240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1441 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  100 
 
 		 253 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  100 
 
 		 253 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  99.21 
 
 		 253 aa  493  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  94.47 
 
 		 253 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  92.89 
 
 		 253 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  90.51 
 
 		 253 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5380  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  82.28 
 
 		 254 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.506501  normal  0.128473 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1322  hydratase/decarboxylase family protein  75.98 
 
 		 254 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.831556  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  70.87 
 
 		 366 aa  360  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  70.87 
 
 		 254 aa  357  8e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  70.47 
 
 		 254 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4042  hydratase/decarboxylase family protein  38.37 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0577  hydratase/decarboxylase family protein  39.37 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0548  hydratase/decarboxylase family protein  38.98 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5798  hydratase/decarboxylase family protein  44.22 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000214426  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3762  hydratase/decarboxylase family protein  39.37 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5795  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  45.85 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3602  hydratase/decarboxylase family protein  38.4 
 
 		 271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0572  hydratase/decarboxylase family protein  38.58 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.733432 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3428  hydratase/decarboxylase family protein  39.25 
 
 		 280 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0633  hydratase/decarboxylase family protein  38.43 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0524  hydratase/decarboxylase family protein  38.93 
 
 		 280 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3056  hydratase/decarboxylase family protein  35.47 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2075  hydratase/decarboxylase family protein  36.18 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488863  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.08 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2133  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase  33.6 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0110  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.02 
 
 		 254 aa  99  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00322536  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  30.77 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2038  putative hydratase  32.2 
 
 		 268 aa  92.4  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  32.22 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2003  putative hydratase/decarboxylase  34 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1231  putative hydratase/decarboxylase  33.33 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.2162  normal  0.357566 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3399  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.29 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4255  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  31.45 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0105  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.95 
 
 		 265 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0623  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.25 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6957  Hydratase/decarboxylase  32.63 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3024  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  30.74 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.332921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2258  putative hydratase/decarboxylase  33.07 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0643634  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1767  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  26.1 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6716  hypothetical protein  30.13 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.74 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5815  hypothetical protein  30.92 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3930  hydratase/decarboxylase  33.19 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0554783  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.15 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5145  putative hydratase  28.57 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0494321  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.68 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0742  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  26.62 
 
 		 281 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.27 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.17 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.17 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2652  hydratase/decarboxylase  28.88 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2159  hydratase/decarboxylase  28.88 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.61 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.33 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.74 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3153  hydratase/decarboxylase  29.75 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.74 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3885  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.54 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.2 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.13 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.43 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.3 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  26.47 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3044  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  26.69 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111412 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  29.75 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.33 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  29.75 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4284  hydratase/decarboxylase  29.48 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2908  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  27.96 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.09 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1904  hydratase/decarboxylase  26.51 
 
 		 270 aa  62  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2420  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.92 
 
 		 278 aa  62  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.81 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.31 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.92 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3129  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.1 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159572  normal  0.889794 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3446  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.61 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4445  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.12 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549639  normal  0.132657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.7 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3592  hydratase/decarboxylase  28.85 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0650  putative hydratase  28.05 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0240  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.38 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.34 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.02 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0200  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.43 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.428998  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5040  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.4 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2504  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.09 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.63 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.79 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0876  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.12 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.355708 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.96 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1671  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.39 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.444038  normal  0.899188 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1787  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.01 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.995557  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.72 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1064  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.86 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0212  hypothetical protein  28.52 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2889  hydratase/decarboxylase  31.87 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0101  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.52 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04192  hypothetical protein  30.86 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>