More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2901 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  42.56 
 
 		 1108 aa  649    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  46.63 
 
 		 1111 aa  811    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  43.45 
 
 		 1144 aa  661    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  43.16 
 
 		 1103 aa  749    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  42.36 
 
 		 1167 aa  651    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  49.06 
 
 		 1192 aa  818    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  44.52 
 
 		 1162 aa  651    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  49.02 
 
 		 1128 aa  759    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1136 aa  2175    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  51.03 
 
 		 1162 aa  670    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  41.98 
 
 		 1183 aa  659    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.38 
 
 		 1094 aa  632  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  41.3 
 
 		 1128 aa  625  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  42.98 
 
 		 1128 aa  622  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.88 
 
 		 1176 aa  616  1e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  40.57 
 
 		 1041 aa  596  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.78 
 
 		 1119 aa  598  1e-169  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  39.18 
 
 		 1119 aa  589  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  41.2 
 
 		 1111 aa  586  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  40.86 
 
 		 1150 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  40.05 
 
 		 1164 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  40.24 
 
 		 1106 aa  581  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  42.91 
 
 		 1120 aa  580  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.57 
 
 		 1090 aa  567  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  41.69 
 
 		 1130 aa  555  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  39.24 
 
 		 1091 aa  545  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  39.29 
 
 		 1073 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  40.11 
 
 		 1091 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  40.05 
 
 		 1091 aa  535  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  40.05 
 
 		 1091 aa  535  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  39.86 
 
 		 1086 aa  520  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  39.04 
 
 		 1101 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43.19 
 
 		 1228 aa  515  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  41.19 
 
 		 1088 aa  509  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  36.12 
 
 		 1124 aa  504  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  39.98 
 
 		 1349 aa  442  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  25.39 
 
 		 1397 aa  200  1.0000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.14 
 
 		 729 aa  194  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  29.7 
 
 		 1343 aa  185  4.0000000000000006e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.71 
 
 		 715 aa  179  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.57 
 
 		 732 aa  172  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  26.37 
 
 		 736 aa  172  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  29.2 
 
 		 1177 aa  170  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  24.8 
 
 		 1019 aa  167  8e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.47 
 
 		 833 aa  166  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.22 
 
 		 730 aa  166  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.22 
 
 		 730 aa  166  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.17 
 
 		 729 aa  164  6e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.59 
 
 		 725 aa  163  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  26.12 
 
 		 707 aa  162  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  23.63 
 
 		 757 aa  162  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.95 
 
 		 773 aa  160  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  29.22 
 
 		 1180 aa  160  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  25.48 
 
 		 744 aa  160  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  26.04 
 
 		 900 aa  159  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.1 
 
 		 785 aa  159  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  25.97 
 
 		 739 aa  157  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  30.74 
 
 		 1044 aa  157  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.79 
 
 		 766 aa  157  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  25.57 
 
 		 768 aa  157  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0787  UvrD/REP helicase  26.04 
 
 		 800 aa  155  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.82156  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.85 
 
 		 747 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  25.58 
 
 		 678 aa  156  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.73 
 
 		 753 aa  155  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.7 
 
 		 753 aa  155  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.85 
 
 		 751 aa  155  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  22.85 
 
 		 753 aa  155  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  22.85 
 
 		 751 aa  155  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.85 
 
 		 751 aa  155  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.66 
 
 		 857 aa  155  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.48 
 
 		 741 aa  154  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.73 
 
 		 751 aa  153  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  24.6 
 
 		 743 aa  153  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4015  ATP-dependent DNA helicase Rep  25 
 
 		 675 aa  153  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  26.8 
 
 		 771 aa  152  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.73 
 
 		 747 aa  153  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  28.3 
 
 		 646 aa  153  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 795 aa  152  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  25.25 
 
 		 798 aa  152  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  23.24 
 
 		 689 aa  152  4e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.83 
 
 		 748 aa  152  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  24.73 
 
 		 762 aa  152  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  23.01 
 
 		 689 aa  152  5e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  27.65 
 
 		 659 aa  152  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.95 
 
 		 831 aa  151  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5264  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.44 
 
 		 669 aa  151  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5174  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.44 
 
 		 669 aa  151  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0206  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.47 
 
 		 669 aa  150  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0188843 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4207  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.64 
 
 		 673 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.45 
 
 		 858 aa  150  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 795 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.37 
 
 		 747 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.92 
 
 		 858 aa  150  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  25.66 
 
 		 743 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.36 
 
 		 838 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  23.83 
 
 		 678 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.2 
 
 		 757 aa  149  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  24.03 
 
 		 770 aa  150  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.74 
 
 		 759 aa  149  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.04 
 
 		 758 aa  148  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>