More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1765 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 214 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  64.14 
 
 		 200 aa  224  6e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  64.32 
 
 		 204 aa  217  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  60 
 
 		 202 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  62.05 
 
 		 199 aa  206  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  56.57 
 
 		 217 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  58.85 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  54.71 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  56.8 
 
 		 208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  61.22 
 
 		 202 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  52.7 
 
 		 223 aa  192  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  54.59 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  54.46 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  54.37 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  56.7 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  53.39 
 
 		 222 aa  187  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  43.06 
 
 		 215 aa  187  9e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  53.73 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  56.85 
 
 		 201 aa  184  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  56 
 
 		 210 aa  184  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  55.44 
 
 		 208 aa  184  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  46.67 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  56.22 
 
 		 204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  47.76 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  55 
 
 		 204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  50.26 
 
 		 193 aa  181  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  49.75 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  53.4 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  54.04 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  54.04 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  54.04 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  55.84 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  52.5 
 
 		 205 aa  175  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  54.64 
 
 		 203 aa  174  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  51.03 
 
 		 218 aa  174  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  52.97 
 
 		 227 aa  174  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  54.55 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  47.24 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  45.36 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  55.21 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  51.28 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  41.97 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  51.52 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  47.5 
 
 		 223 aa  171  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  48.77 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  47.18 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  46.97 
 
 		 221 aa  168  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  43.59 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  45.69 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  50.49 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  51.03 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  46.39 
 
 		 221 aa  168  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  43.59 
 
 		 217 aa  167  9e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  45.24 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  45.24 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  45.24 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  48.89 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  45.24 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  44.83 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  44.83 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  50.51 
 
 		 215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  50.51 
 
 		 215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  50.26 
 
 		 215 aa  164  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 214 aa  164  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  46.15 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  47.72 
 
 		 219 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  45.67 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  46.31 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  45.32 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  43.01 
 
 		 196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  50.75 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  45.16 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  45.67 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  47.48 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  49.51 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  45.93 
 
 		 218 aa  161  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10860  riboflavin synthase, alpha subunit  49.77 
 
 		 218 aa  161  6e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0695867  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  45.93 
 
 		 218 aa  161  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  44.7 
 
 		 220 aa  161  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  46.91 
 
 		 216 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  42.03 
 
 		 216 aa  161  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  42.93 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  43.75 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  45.28 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3916  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 202 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  44.24 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  48.47 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  43.52 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  49.48 
 
 		 227 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  46.94 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  50.25 
 
 		 196 aa  159  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  47.74 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  44.62 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  54.27 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  44.85 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  44.85 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>