More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1577 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 390 aa  798    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  56.07 
 
 		 403 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  59.9 
 
 		 393 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  59.49 
 
 		 390 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  56.19 
 
 		 390 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  55.3 
 
 		 396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  55.81 
 
 		 399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  54.12 
 
 		 699 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  59.7 
 
 		 405 aa  359  4e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  46.68 
 
 		 397 aa  332  6e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7455  hypothetical protein  50 
 
 		 227 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  29.97 
 
 		 429 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  28.02 
 
 		 393 aa  122  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  28.4 
 
 		 496 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  28.38 
 
 		 421 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  27.64 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 431 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  25 
 
 		 421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  25.81 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  25.85 
 
 		 431 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  29.97 
 
 		 444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  25 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  29.93 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 		 435 aa  110  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  27.25 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  30.89 
 
 		 427 aa  106  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  34.84 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  30.85 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  24.46 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  32.34 
 
 		 493 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  33 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 		 347 aa  99.8  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  31.51 
 
 		 470 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  27.07 
 
 		 452 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.08 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  23.44 
 
 		 416 aa  96.7  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  31.92 
 
 		 467 aa  96.3  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  30.96 
 
 		 358 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  33.18 
 
 		 450 aa  94.4  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  29.25 
 
 		 340 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 		 385 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  28.88 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  28.88 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  31.27 
 
 		 341 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  33.91 
 
 		 358 aa  90.5  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  31.63 
 
 		 336 aa  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  35.05 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1110  oxidoreductase-like protein  26.24 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00265336  hitchhiker  0.0048453 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  33.17 
 
 		 339 aa  87.8  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  27.5 
 
 		 310 aa  87.8  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  28.23 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  34.2 
 
 		 333 aa  86.7  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  25.74 
 
 		 377 aa  86.3  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0302  oxidoreductase domain protein  25.99 
 
 		 464 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.451062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  29.24 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  33.85 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  30.84 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28.43 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  24.81 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1659  oxidoreductase domain protein  37.76 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  34.72 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  29.07 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  25.83 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  35.43 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5530  oxidoreductase domain protein  30.74 
 
 		 411 aa  82.8  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  31.19 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  26.91 
 
 		 414 aa  82.8  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  27.06 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  35.29 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  21.6 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  27.75 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  20.9 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  28.5 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2166  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.81218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  33.55 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  27.98 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1048  oxidoreductase domain-containing protein  27.81 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.448338  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 500 aa  81.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  26.38 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  28.08 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  26.22 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  25.35 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  25.42 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  28.7 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  25.6 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  25.16 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  26.71 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  22.67 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  31.02 
 
 		 383 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  30.77 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  26 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  26.73 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  27.05 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>