221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6427 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6427  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 512 aa  1055    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4914 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1409  Sel1 repeat-containing protein  86.72 
 
 		 520 aa  935    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6420  Sel1 domain-containing protein  86.72 
 
 		 520 aa  935    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111897 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5678  Sel1 domain-containing protein  80.12 
 
 		 372 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1328  Sel1 domain-containing protein  44.38 
 
 		 548 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4350  Sel1 domain-containing protein  45.85 
 
 		 512 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2997  hypothetical protein  42 
 
 		 546 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3861  Sel1 domain protein repeat-containing protein  55.29 
 
 		 451 aa  316  8e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3863  Sel1 domain protein repeat-containing protein  52.82 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.986909  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3862  Sel1 domain protein repeat-containing protein  50.16 
 
 		 435 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2590  putative lipoprotein  47.52 
 
 		 423 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994803  normal  0.253297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2592  putative lipoprotein  48.39 
 
 		 423 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2591  hypothetical protein  47.1 
 
 		 465 aa  256  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853586  normal  0.281141 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2593  putative lipoprotein  48.06 
 
 		 454 aa  247  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.866196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67200  hypothetical protein  34.17 
 
 		 289 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00145906  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03736  lipoprotein  32.74 
 
 		 436 aa  133  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.54167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67210  hypothetical protein  34.42 
 
 		 291 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00555616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67180  hypothetical protein  32.74 
 
 		 289 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00804523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0582  TPR repeat-containing protein  34.05 
 
 		 345 aa  126  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67190  hypothetical protein  33.21 
 
 		 293 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0024226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0628  Sel1  32.01 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4176  Sel1 domain-containing protein  32.62 
 
 		 412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0630  Sel1  31.07 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4971  Sel1 repeat-containing protein  27.18 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4972  Sel1 repeat-containing protein  30.13 
 
 		 343 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  31.31 
 
 		 961 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  29.44 
 
 		 2413 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.62 
 
 		 684 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  30.73 
 
 		 789 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  28.65 
 
 		 831 aa  65.1  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1402 aa  63.9  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.48 
 
 		 282 aa  62.4  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1493 aa  62  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  38.78 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  35.11 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.81 
 
 		 341 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  25.62 
 
 		 235 aa  59.3  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  33.98 
 
 		 208 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 1032 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  38.14 
 
 		 1002 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  37.76 
 
 		 1037 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6892  Sel1 repeat-containing protein  33.67 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 		 705 aa  58.2  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  36 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  34.69 
 
 		 552 aa  56.6  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.73 
 
 		 1261 aa  56.6  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.2 
 
 		 318 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1877 aa  56.6  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  29.63 
 
 		 342 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.72 
 
 		 528 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  36.54 
 
 		 256 aa  54.7  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1160 aa  55.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  31.58 
 
 		 328 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  26.77 
 
 		 209 aa  54.3  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  27.86 
 
 		 264 aa  53.5  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  37.11 
 
 		 294 aa  53.5  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.11 
 
 		 294 aa  53.5  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.9 
 
 		 512 aa  53.5  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 		 487 aa  53.5  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  31.63 
 
 		 693 aa  53.5  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2980  Sel1 domain-containing protein  34.78 
 
 		 254 aa  53.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.456006 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  25.23 
 
 		 376 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.34 
 
 		 347 aa  52.8  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  31.96 
 
 		 838 aa  53.1  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1281 aa  52.8  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1929  Sel1 repeat-containing protein  33.71 
 
 		 228 aa  53.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3536  Sel1  30.68 
 
 		 357 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  29.22 
 
 		 315 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.34 
 
 		 321 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  32.12 
 
 		 523 aa  52.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  32 
 
 		 448 aa  52.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0788  Sel1 domain-containing protein  35.05 
 
 		 234 aa  53.5  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191842 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2048  putative multiprotein complex assembly protein  32.67 
 
 		 229 aa  53.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  35.11 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  32.76 
 
 		 202 aa  52.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  30.43 
 
 		 490 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.9 
 
 		 1110 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  37.93 
 
 		 254 aa  52.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  40.22 
 
 		 976 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  26.42 
 
 		 1044 aa  52.8  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  26.42 
 
 		 1078 aa  52.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.95 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  25.23 
 
 		 376 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0154  Sel1 domain-containing protein  37.7 
 
 		 350 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0876617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  34.69 
 
 		 489 aa  51.6  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  35.11 
 
 		 380 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.48 
 
 		 380 aa  52  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.82 
 
 		 316 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  33.59 
 
 		 393 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.03 
 
 		 209 aa  51.2  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0303  hypothetical protein  37.63 
 
 		 190 aa  50.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.921307  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  27.64 
 
 		 425 aa  51.2  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  28.66 
 
 		 1105 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  30.53 
 
 		 731 aa  51.2  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.2 
 
 		 811 aa  51.2  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3521  Sel1 domain-containing protein  41.11 
 
 		 387 aa  51.2  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.894704  normal  0.280761 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0479  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.63 
 
 		 190 aa  50.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0237479  hitchhiker  0.0000406218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  37.5 
 
 		 464 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>