More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4910 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  76.85 
 
 		 596 aa  952    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  76.85 
 
 		 596 aa  952    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  93.61 
 
 		 595 aa  1134    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  76.85 
 
 		 596 aa  952    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  93.78 
 
 		 595 aa  1135    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  77.68 
 
 		 596 aa  964    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  67.44 
 
 		 602 aa  828    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  93.78 
 
 		 595 aa  1136    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  97.48 
 
 		 618 aa  1176    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  93.78 
 
 		 595 aa  1136    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  66.78 
 
 		 602 aa  824    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 595 aa  1201    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  91.43 
 
 		 595 aa  1113    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  51.95 
 
 		 590 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  51.77 
 
 		 592 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  48.42 
 
 		 590 aa  524  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 		 602 aa  438  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  45.67 
 
 		 568 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.28 
 
 		 588 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  40.73 
 
 		 592 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  41.86 
 
 		 588 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  41.86 
 
 		 588 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  41.86 
 
 		 588 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  54.05 
 
 		 320 aa  325  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  37.48 
 
 		 543 aa  318  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3576  short chain dehydrogenase  36.79 
 
 		 538 aa  299  8e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129186  normal  0.037556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  47.74 
 
 		 340 aa  289  9e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4518  alpha/beta hydrolase fold  50.98 
 
 		 342 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0590754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4650  alpha/beta hydrolase fold protein  50.98 
 
 		 342 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0286073 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1474  alpha/beta fold family hydrolase  47.77 
 
 		 316 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1344  alpha/beta fold family hydrolase  47.3 
 
 		 317 aa  264  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2522  alpha/beta fold family hydrolase  47.3 
 
 		 317 aa  263  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0561  EphD  47.3 
 
 		 317 aa  263  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.284331  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1006  alpha/beta fold family hydrolase  47.3 
 
 		 317 aa  263  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1267  alpha/beta fold family hydrolase  46.98 
 
 		 317 aa  263  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3548  alpha/beta hydrolase fold  49.82 
 
 		 293 aa  262  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4876  alpha/beta hydrolase fold  47 
 
 		 321 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000503768  normal  0.514103 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1142  Alpha/beta hydrolase  45.6 
 
 		 307 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4529  alpha/beta hydrolase fold  46.08 
 
 		 311 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.190868 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  47.22 
 
 		 303 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5623  alpha/beta hydrolase fold  46.02 
 
 		 312 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3691  alpha/beta hydrolase fold  46.02 
 
 		 312 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4071  alpha/beta hydrolase fold  47.81 
 
 		 310 aa  251  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4677  alpha/beta hydrolase fold  46.02 
 
 		 312 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246976  normal  0.206505 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1792  putative hydrolase  47.46 
 
 		 316 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000565691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  45.73 
 
 		 315 aa  232  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1140  alpha/beta fold family hydrolase  41.75 
 
 		 308 aa  190  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0689  alpha/beta fold family hydrolase  41.75 
 
 		 308 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2203  alpha/beta fold family hydrolase  41.75 
 
 		 308 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1296  alpha/beta fold family hydrolase  41.75 
 
 		 308 aa  189  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1132  alpha/beta fold family hydrolase  41.75 
 
 		 308 aa  189  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.366992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2091  alpha/beta fold family hydrolase  41.75 
 
 		 308 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2521  alpha/beta fold family hydrolase  41.75 
 
 		 750 aa  188  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2355  alpha/beta fold family hydrolase  41.31 
 
 		 345 aa  172  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110523  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.22 
 
 		 275 aa  161  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 		 278 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0476  alpha/beta hydrolase fold protein  35.62 
 
 		 298 aa  145  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  33.84 
 
 		 295 aa  143  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 		 278 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 267 aa  140  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  33.08 
 
 		 295 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.41 
 
 		 282 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  30.19 
 
 		 273 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 		 279 aa  138  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  42.71 
 
 		 292 aa  137  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.72 
 
 		 295 aa  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 		 277 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  30.57 
 
 		 273 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 		 263 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.99 
 
 		 278 aa  134  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.74 
 
 		 284 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.74 
 
 		 284 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.74 
 
 		 284 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 275 aa  133  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 		 273 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  38.82 
 
 		 265 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1810  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 		 285 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1857  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 		 285 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1791  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 		 285 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4313  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 		 290 aa  127  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  40.09 
 
 		 301 aa  127  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 280 aa  127  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.370364  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 		 275 aa  127  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00962961  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 		 276 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13074  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 287 aa  126  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.486367 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 		 308 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 273 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 309 aa  124  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 300 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.88 
 
 		 298 aa  124  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  35.71 
 
 		 305 aa  124  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 		 276 aa  124  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37 
 
 		 285 aa  124  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 		 276 aa  124  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 		 276 aa  124  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 		 300 aa  124  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  34.24 
 
 		 276 aa  124  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 		 300 aa  123  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 		 308 aa  123  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 		 300 aa  123  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>