More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1090 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1090  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  100 
 
 		 514 aa  1066    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0985  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 511 aa  249  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3892  ABC di/oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.25 
 
 		 518 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206545  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4147  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 518 aa  239  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5763  extracellular solute-binding protein family 5  32.01 
 
 		 508 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  unclonable  0.000000000235373  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6670  extracellular solute-binding protein family 5  31.31 
 
 		 508 aa  220  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000010094  normal  0.0327722 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2984  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 		 508 aa  219  8.999999999999998e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5086  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  30.18 
 
 		 517 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243076  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1214  extracellular solute-binding protein family 5  29.86 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3323  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 527 aa  187  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0934  twin-arginine translocation pathway signal  30.17 
 
 		 537 aa  186  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0656  twin-arginine translocation pathway signal  30.58 
 
 		 521 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.435676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1556  extracellular solute-binding protein family 5  30.93 
 
 		 525 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  31.16 
 
 		 502 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  31.91 
 
 		 520 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5947  extracellular solute-binding protein family 5  29.69 
 
 		 521 aa  162  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.281116  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  33.15 
 
 		 520 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  33.15 
 
 		 520 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  32.87 
 
 		 520 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  31.89 
 
 		 520 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1867  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 		 527 aa  156  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546614  normal  0.0646948 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  31.54 
 
 		 520 aa  156  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 		 520 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.93 
 
 		 520 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1443  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 		 517 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.13157 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 		 520 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  31.16 
 
 		 520 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  31.16 
 
 		 520 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  31.16 
 
 		 520 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  31.16 
 
 		 520 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  31.16 
 
 		 520 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  31.16 
 
 		 520 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  31.16 
 
 		 520 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  29.18 
 
 		 520 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  31.16 
 
 		 520 aa  149  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4726  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 529 aa  149  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5254  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  27 
 
 		 537 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.534405  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.81 
 
 		 512 aa  147  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5253  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  26.7 
 
 		 537 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0401744 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 522 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4745  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 533 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5088  putative oligopeptide/dipeptide ABC transporter  27.97 
 
 		 527 aa  146  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0437131  normal  0.457948 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  27.05 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.05 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.05 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  27.05 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  27.23 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.05 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5818  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 531 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0665054  normal  0.029553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2002  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 527 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.57 
 
 		 517 aa  144  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3927  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 533 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180708  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 		 520 aa  144  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.83 
 
 		 512 aa  144  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1499  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 524 aa  144  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.779721  normal  0.296474 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 512 aa  143  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3800  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 530 aa  144  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129084 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  27.02 
 
 		 512 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  27.02 
 
 		 512 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  27.02 
 
 		 512 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  27.02 
 
 		 512 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  27.42 
 
 		 493 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1200  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0979  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 530 aa  141  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.297745  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1226  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 536 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5251  putative ABC transporter substrate-binding protein  26.37 
 
 		 517 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3643  twin-arginine translocation pathway signal  26.76 
 
 		 533 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.166369  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  29.66 
 
 		 520 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5122  putative ABC transporter periplasmic-binding protein  26.33 
 
 		 534 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259122 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  27.5 
 
 		 521 aa  140  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 512 aa  140  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1835  extracellular solute-binding protein family 5  27.23 
 
 		 544 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 		 520 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  28.41 
 
 		 509 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2436  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 		 514 aa  137  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 518 aa  136  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5806  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 530 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.068843  normal  0.564208 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  26.88 
 
 		 517 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4366  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 528 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 519 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  27.78 
 
 		 514 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 		 516 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4022  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 536 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00714098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.53 
 
 		 510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  28.17 
 
 		 505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  32.9 
 
 		 527 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6643  extracellular solute-binding protein family 5  27.68 
 
 		 514 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19211 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 		 530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0139  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 502 aa  132  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.184027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  27.32 
 
 		 499 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  27.46 
 
 		 514 aa  131  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 		 514 aa  131  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1408  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 518 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00741999  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 564 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 509 aa  130  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0400  extracellular solute-binding protein family 5  27.46 
 
 		 525 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.82 
 
 		 521 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1411  extracellular solute-binding protein family 5  24.65 
 
 		 537 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  27.83 
 
 		 544 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.59 
 
 		 521 aa  127  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>