More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_3846 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_3846  DNA processing Smf protein  100 
 
 
289 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3575  SMF family nucleotide-binding protein  98.62 
 
 
289 aa  587  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00451445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3593  SMF family nucleotide-binding protein  98.27 
 
 
289 aa  587  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.46698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3881  DNA processing Smf protein  95.85 
 
 
289 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000554633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3876  Smf family DNA processing protein  94.46 
 
 
289 aa  567  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000864886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3932  DNA processing Smf protein  89.97 
 
 
289 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000528379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1311  DNA processing Smf protein  89.97 
 
 
289 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3657  DNA protecting protein DprA  85.12 
 
 
289 aa  519  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00245639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3685  nucleotide-binding SMF protein  98.13 
 
 
221 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.455152  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  68.17 
 
 
291 aa  424  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  47.89 
 
 
294 aa  278  8e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  43.66 
 
 
293 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  50.97 
 
 
349 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  41.2 
 
 
406 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
362 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  40.8 
 
 
373 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  40 
 
 
356 aa  199  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  40.28 
 
 
362 aa  199  6e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  42.28 
 
 
394 aa  198  7e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  42.91 
 
 
374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  41.67 
 
 
373 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  43.38 
 
 
358 aa  192  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  41.73 
 
 
370 aa  192  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  46.05 
 
 
333 aa  192  6e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  39.18 
 
 
409 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1305  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  45.61 
 
 
282 aa  191  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  43.28 
 
 
361 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1277  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  42.13 
 
 
288 aa  190  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  43.39 
 
 
366 aa  189  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  46.23 
 
 
279 aa  188  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  37.46 
 
 
364 aa  185  9e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  46.23 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  38.46 
 
 
363 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  45.19 
 
 
280 aa  182  6e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  44.76 
 
 
374 aa  181  8.000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  39.04 
 
 
359 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0915  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  42.86 
 
 
281 aa  181  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483862 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  43.44 
 
 
364 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  46.83 
 
 
365 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  46.83 
 
 
365 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1609  DNA protecting protein DprA  45.16 
 
 
264 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.709828  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  39.85 
 
 
361 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  39.26 
 
 
360 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  44.86 
 
 
401 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  45.45 
 
 
352 aa  179  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  39 
 
 
320 aa  179  7e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0815  DNA processing protein DprA, putative  40.27 
 
 
290 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.486528  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  39.46 
 
 
361 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  39.49 
 
 
369 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  44.7 
 
 
371 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0778  DNA protecting protein DprA  37.21 
 
 
291 aa  177  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  43.93 
 
 
401 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  37.82 
 
 
405 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  45.45 
 
 
368 aa  176  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  43.93 
 
 
402 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  42.36 
 
 
389 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  41.25 
 
 
372 aa  176  6e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  44.29 
 
 
442 aa  175  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  45.37 
 
 
367 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  42.86 
 
 
375 aa  174  9.999999999999999e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2080  DNA protecting protein DprA  44.98 
 
 
229 aa  175  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  38.08 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  37.08 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  35.19 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  45.32 
 
 
365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  35.76 
 
 
375 aa  173  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  35.64 
 
 
365 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  39.92 
 
 
364 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  39.26 
 
 
359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  39.27 
 
 
369 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  37.72 
 
 
369 aa  172  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  45.28 
 
 
425 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  44.02 
 
 
418 aa  172  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  43.93 
 
 
374 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  44.98 
 
 
308 aa  172  6.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  44.55 
 
 
386 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  42.86 
 
 
356 aa  171  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  40.78 
 
 
377 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  43.06 
 
 
369 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  37.02 
 
 
379 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  44.55 
 
 
386 aa  170  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  40.48 
 
 
358 aa  170  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  34.62 
 
 
366 aa  170  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0092  DNA processing chain A  44.93 
 
 
362 aa  169  4e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  42.34 
 
 
553 aa  169  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  39.67 
 
 
389 aa  169  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  39.59 
 
 
360 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  43.87 
 
 
364 aa  169  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  45.71 
 
 
385 aa  169  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  42.53 
 
 
399 aa  168  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  37.07 
 
 
372 aa  168  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  44.5 
 
 
339 aa  168  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  37.77 
 
 
382 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  35.48 
 
 
399 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  42.58 
 
 
369 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  40.36 
 
 
385 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  40 
 
 
377 aa  167  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  38.03 
 
 
337 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  38.31 
 
 
377 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>