More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0612 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0612  response regulator  100 
 
 
120 aa  242  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4284  response regulator receiver protein  85.83 
 
 
130 aa  207  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0043  response regulator  85.83 
 
 
120 aa  206  7e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.868286  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0040  response regulator  85.83 
 
 
120 aa  206  7e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2750  response regulator receiver protein  84.17 
 
 
120 aa  200  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000684047  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3746  chemotaxis response regulator  78.15 
 
 
121 aa  193  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193057  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2719  response regulator receiver protein  79.49 
 
 
120 aa  192  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0959171  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3624  response regulator receiver protein  77.97 
 
 
120 aa  190  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3325  response regulator receiver protein  77.97 
 
 
120 aa  190  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2816  response regulator receiver protein  76.67 
 
 
120 aa  189  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101903  normal  0.104606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0976  response regulator receiver protein  73.11 
 
 
119 aa  183  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351318  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4515  response regulator receiver domain-containing protein  73.11 
 
 
119 aa  183  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.403365  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4356  response regulator receiver  73.11 
 
 
119 aa  183  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00220083  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0043  response regulator receiver protein  76.07 
 
 
118 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0842812  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3474  response regulator receiver protein  76.07 
 
 
118 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.790484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5217  response regulator receiver protein  76.07 
 
 
118 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3600  response regulator receiver protein  76.07 
 
 
118 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11211  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3276  response regulator receiver  76.07 
 
 
118 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5952  response regulator receiver protein  76.07 
 
 
118 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0493294  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2946  response regulator receiver  72.27 
 
 
135 aa  181  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1143  response regulator receiver domain-containing protein  72.27 
 
 
119 aa  181  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0781  response regulator receiver domain-containing protein  71.43 
 
 
119 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.394955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1391  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  72.27 
 
 
119 aa  180  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00446889  normal  0.206531 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1234  response regulator receiver protein  73.5 
 
 
138 aa  180  7e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0344647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3644  response regulator receiver protein  73.5 
 
 
127 aa  175  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00272169  normal  0.799381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1998  response regulator receiver protein  65.83 
 
 
120 aa  152  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000230643  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2507  response regulator receiver protein  61.98 
 
 
121 aa  149  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0135  response regulator receiver protein  62.39 
 
 
124 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0863  response regulator receiver protein  59.66 
 
 
118 aa  138  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1287  response regulator receiver domain-containing protein  58.12 
 
 
127 aa  137  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1335  response regulator receiver protein  53.85 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51819  normal  0.0884587 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1598  response regulator receiver protein  41.8 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1267  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
542 aa  84.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1216  sensor histidine kinase/response regulator  38.46 
 
 
417 aa  84  6e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0366  sensor histidine kinase/response regulator  39.13 
 
 
742 aa  83.2  0.000000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3862  response regulator receiver protein  36.97 
 
 
119 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762525  normal  0.105944 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1929  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 
853 aa  82  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3569  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
119 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0755  sensor histidine kinase/response regulator  32.46 
 
 
828 aa  81.3  0.000000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2540  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
119 aa  80.9  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676292  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0319  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.33 
 
 
824 aa  80.1  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.655044  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
939 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2820  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  37.39 
 
 
829 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
941 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 
766 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 
770 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3094  response regulator receiver protein  38.02 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
888 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4023  two component response regulator  36.97 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3546  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
688 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2228  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
688 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1174  putative two-component response regulator  36.97 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 
857 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2377  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 
688 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0941  response regulator receiver  38.02 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 
803 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
853 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
925 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
796 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.63 
 
 
472 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 
890 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  35 
 
 
866 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 
817 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  35.29 
 
 
892 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
1013 aa  73.9  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  37.07 
 
 
695 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1446  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 
811 aa  73.9  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0606  response regulator  43.9 
 
 
447 aa  73.9  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  33.91 
 
 
1065 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1034 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  35.34 
 
 
695 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0832  response regulator receiver domain-containing protein  39.82 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155773  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
622 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3997  response regulator receiver protein  39.67 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0883649 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3086  response regulator receiver protein  38.84 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342425  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3222  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
798 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.150716 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2860  response regulator receiver  38.84 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.388237  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0444  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
713 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5149  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 
869 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416194 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
796 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5220  response regulator receiver protein  38.89 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
668 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
766 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  36.97 
 
 
945 aa  72  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  38.94 
 
 
594 aa  71.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0848  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 
698 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.132769  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
1067 aa  71.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  36.97 
 
 
945 aa  72  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
818 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
556 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.936608  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1530  response regulator receiver protein  40.74 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.754323  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
546 aa  71.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00154548  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3603  response regulator receiver protein  35.83 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.656399  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  34.45 
 
 
571 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2716  response regulator  33.62 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
840 aa  70.9  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3461  response regulator receiver protein  34.75 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  36.97 
 
 
733 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1039  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
798 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0878  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 
754 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307069  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>