More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0069 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 629 aa  1310    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  38.27 
 
 		 459 aa  247  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  33.05 
 
 		 469 aa  246  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  32.69 
 
 		 462 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  37.7 
 
 		 504 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  37.25 
 
 		 475 aa  219  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  35.45 
 
 		 581 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  34.32 
 
 		 536 aa  173  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  35.03 
 
 		 560 aa  172  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  33.94 
 
 		 560 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  32.36 
 
 		 560 aa  166  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2849  type III restriction enzyme, res subunit  34.02 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  32.35 
 
 		 588 aa  158  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4439  type III restriction protein res subunit  32.88 
 
 		 510 aa  157  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  32.22 
 
 		 560 aa  157  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 		 584 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  31.16 
 
 		 560 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  32.22 
 
 		 398 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  28.77 
 
 		 773 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  32.7 
 
 		 602 aa  154  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  32.67 
 
 		 560 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  33.06 
 
 		 584 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  32.97 
 
 		 580 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  32.79 
 
 		 584 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  32.7 
 
 		 580 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  30.48 
 
 		 643 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  32.79 
 
 		 584 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  32.79 
 
 		 590 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  32.88 
 
 		 590 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  31.78 
 
 		 385 aa  151  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  30.55 
 
 		 606 aa  150  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  32.34 
 
 		 583 aa  150  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11338  hypothetical protein  30.8 
 
 		 503 aa  150  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  33.69 
 
 		 574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  31.27 
 
 		 607 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  32.73 
 
 		 579 aa  148  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  30.93 
 
 		 580 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  31.82 
 
 		 590 aa  146  9e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  28.33 
 
 		 993 aa  145  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  31.82 
 
 		 590 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  28.5 
 
 		 550 aa  145  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  31.81 
 
 		 586 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  31.54 
 
 		 586 aa  144  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  31.81 
 
 		 586 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  32.34 
 
 		 616 aa  144  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  31.81 
 
 		 586 aa  144  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  31.54 
 
 		 586 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  31.54 
 
 		 586 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  31.54 
 
 		 586 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  31.54 
 
 		 586 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  31.54 
 
 		 586 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  29.15 
 
 		 848 aa  142  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  31.62 
 
 		 586 aa  142  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  31.54 
 
 		 586 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  31.27 
 
 		 586 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  31.27 
 
 		 586 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  31.27 
 
 		 586 aa  141  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  28.36 
 
 		 538 aa  140  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  28.61 
 
 		 545 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  29.81 
 
 		 569 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  30 
 
 		 812 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  32.83 
 
 		 1077 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  28.4 
 
 		 524 aa  135  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  28.61 
 
 		 545 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  30.19 
 
 		 584 aa  134  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1623  helicase domain-containing protein  27.62 
 
 		 502 aa  134  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  30.73 
 
 		 583 aa  133  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  28.14 
 
 		 967 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  30.81 
 
 		 586 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.82 
 
 		 657 aa  133  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  28.93 
 
 		 545 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  28.37 
 
 		 1418 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  30.19 
 
 		 583 aa  132  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  31.08 
 
 		 585 aa  131  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  30.77 
 
 		 1052 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  30.59 
 
 		 591 aa  130  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  27.91 
 
 		 813 aa  130  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0307  Type III restriction enzyme, res subunit  31.54 
 
 		 539 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0435132  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  28.71 
 
 		 613 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  31.63 
 
 		 1062 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  28.57 
 
 		 1053 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  29.3 
 
 		 586 aa  128  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  31.55 
 
 		 1063 aa  127  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  29.65 
 
 		 586 aa  127  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  31.18 
 
 		 1033 aa  127  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  26.68 
 
 		 1149 aa  126  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  28.9 
 
 		 1029 aa  125  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  31.99 
 
 		 956 aa  125  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  28.75 
 
 		 585 aa  124  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  30.95 
 
 		 1051 aa  124  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  31.68 
 
 		 928 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  30.54 
 
 		 586 aa  124  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  30.9 
 
 		 1033 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  30.17 
 
 		 1066 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  30.27 
 
 		 1287 aa  121  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  26.8 
 
 		 815 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  24.77 
 
 		 953 aa  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  24.77 
 
 		 953 aa  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  29.75 
 
 		 585 aa  121  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  29.75 
 
 		 585 aa  121  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>