79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2063 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  100 
 
 
459 aa  945    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  49.27 
 
 
478 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  50 
 
 
459 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  49.43 
 
 
451 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  42.99 
 
 
435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  26.73 
 
 
429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  27.14 
 
 
466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  26.74 
 
 
465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  26.37 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  46.28 
 
 
369 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  27.56 
 
 
464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  25.06 
 
 
377 aa  117  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  28.72 
 
 
378 aa  116  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  45.08 
 
 
224 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  27.46 
 
 
408 aa  110  8.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  25.1 
 
 
457 aa  108  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  26.68 
 
 
391 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  31.42 
 
 
428 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  29.75 
 
 
527 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  35.92 
 
 
378 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  38.62 
 
 
363 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  39.5 
 
 
374 aa  98.6  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  38.14 
 
 
371 aa  94.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  34.15 
 
 
227 aa  91.3  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  34.96 
 
 
378 aa  84  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  32.21 
 
 
510 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  31.47 
 
 
508 aa  78.2  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  32.31 
 
 
368 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  29.32 
 
 
467 aa  75.5  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  26.99 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  32.62 
 
 
514 aa  71.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  27.86 
 
 
617 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  52.11 
 
 
457 aa  69.3  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  39.77 
 
 
461 aa  64.3  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  35.16 
 
 
513 aa  64.7  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  25 
 
 
483 aa  62.4  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  34.62 
 
 
565 aa  60.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  29.32 
 
 
555 aa  60.1  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  32.85 
 
 
595 aa  60.1  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  30.59 
 
 
460 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  30.59 
 
 
460 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1940  hypothetical protein  40.96 
 
 
419 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.34914  hitchhiker  0.0000000111377 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1118  hypothetical protein  40.96 
 
 
419 aa  51.2  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.146528  hitchhiker  0.0000000167216 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  20.68 
 
 
382 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  23.61 
 
 
394 aa  48.9  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1517  hypothetical protein  40.85 
 
 
556 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.019243  normal  0.812738 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0789  hypothetical protein  40.68 
 
 
396 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  32.81 
 
 
355 aa  47.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  25.74 
 
 
476 aa  47  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  31.54 
 
 
399 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  27.45 
 
 
634 aa  46.6  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  22.55 
 
 
442 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  20.15 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  34.07 
 
 
388 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0471  hypothetical protein  24.43 
 
 
533 aa  45.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0692558  decreased coverage  0.00000000612882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  21.62 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  39.06 
 
 
451 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  40 
 
 
422 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  29.31 
 
 
385 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  27.43 
 
 
362 aa  44.7  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2348  hypothetical protein  23.81 
 
 
461 aa  44.3  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  26 
 
 
395 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  40 
 
 
416 aa  44.3  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  38.71 
 
 
377 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  38.67 
 
 
597 aa  44.3  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  34.88 
 
 
397 aa  44.3  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0135  hypothetical protein  33.78 
 
 
96 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.203  normal  0.0435696 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2242  ABC transporter related  25.64 
 
 
499 aa  43.5  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1487  hypothetical protein  29.59 
 
 
343 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.10218  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  27.22 
 
 
398 aa  43.5  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  27.82 
 
 
529 aa  43.5  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  27.83 
 
 
226 aa  43.5  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  29.29 
 
 
386 aa  43.5  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  27.54 
 
 
397 aa  43.5  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  25.37 
 
 
394 aa  43.1  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  35.48 
 
 
390 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1441  hypothetical protein  27.66 
 
 
307 aa  43.1  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0532167  hitchhiker  0.00000885873 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3383  hypothetical protein  30.88 
 
 
456 aa  43.1  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  44.44 
 
 
378 aa  43.1  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>