179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0310 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  100 
 
 
412 aa  815    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  43.95 
 
 
448 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  43.5 
 
 
448 aa  332  6e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  25.65 
 
 
399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  25.75 
 
 
409 aa  109  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  24.7 
 
 
411 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  24.06 
 
 
424 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  25.78 
 
 
370 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  25.35 
 
 
397 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  23.6 
 
 
380 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  25.3 
 
 
378 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  23.91 
 
 
395 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  23.21 
 
 
367 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  23.91 
 
 
395 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  23.21 
 
 
367 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  25.31 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  24.94 
 
 
416 aa  97.8  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  25.24 
 
 
405 aa  91.3  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  26.02 
 
 
363 aa  91.3  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  23.9 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  23.75 
 
 
416 aa  90.1  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  22.3 
 
 
398 aa  90.1  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  23.19 
 
 
394 aa  89.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  24.71 
 
 
369 aa  88.6  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  24.58 
 
 
363 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  23.82 
 
 
370 aa  84  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  24.23 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  19.9 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  24.6 
 
 
430 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  21.09 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  22.64 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  24.44 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  19.29 
 
 
397 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  25.45 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  25.06 
 
 
364 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  22.78 
 
 
422 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1458  hypothetical protein  28.65 
 
 
431 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  21.2 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  21.2 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  22.83 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  21.91 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  20.87 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4110  ATPase-like protein  22.47 
 
 
427 aa  73.2  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000135453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  25.69 
 
 
364 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  24.87 
 
 
418 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  27.56 
 
 
357 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  31.4 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  24.55 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  31.33 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  22.6 
 
 
369 aa  69.3  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  22.17 
 
 
584 aa  69.3  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  22.65 
 
 
365 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  24.53 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  21.78 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  23.64 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  32.34 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0617  hypothetical protein  36.11 
 
 
125 aa  67.8  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  27.27 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  23.39 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  21.55 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  27.27 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  24.48 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  20.9 
 
 
386 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  28.42 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  21.2 
 
 
384 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  27 
 
 
378 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  21.29 
 
 
385 aa  65.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  20.51 
 
 
395 aa  64.7  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  25 
 
 
419 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2264  hypothetical protein  35.79 
 
 
385 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.000000152095  unclonable  0.0000000148287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8073  ATPase-like protein  22.87 
 
 
362 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4080  hypothetical protein  45.31 
 
 
397 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  21.59 
 
 
382 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  29.1 
 
 
385 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  22.53 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0931  hypothetical protein  27.67 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.47 
 
 
595 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  27.44 
 
 
226 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  38.71 
 
 
410 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  37.1 
 
 
393 aa  57.4  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  22.74 
 
 
386 aa  57.4  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1890  hypothetical protein  36.05 
 
 
389 aa  57  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  27.06 
 
 
454 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  24.63 
 
 
416 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  40.58 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  24.53 
 
 
373 aa  55.1  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  35.48 
 
 
390 aa  54.3  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  32 
 
 
708 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  29.85 
 
 
417 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  28.49 
 
 
369 aa  53.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  27.56 
 
 
427 aa  53.5  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  35.48 
 
 
390 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  35.94 
 
 
362 aa  53.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  25.97 
 
 
393 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  23.36 
 
 
397 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0144  putative RecF protein  32.11 
 
 
132 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  40 
 
 
409 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  33.87 
 
 
395 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1118  hypothetical protein  35.29 
 
 
419 aa  51.2  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.146528  hitchhiker  0.0000000167216 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  26.67 
 
 
390 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>