More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1371 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 306 aa  593  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  80.4 
 
 		 322 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  46.57 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  39.22 
 
 		 289 aa  197  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  42.72 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 		 441 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  37.59 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.84 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  40.64 
 
 		 287 aa  192  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  39.65 
 
 		 339 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  39.45 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  43.23 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  41.49 
 
 		 348 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  38.41 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.21 
 
 		 403 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  37.7 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  39.78 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  38.7 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  44.56 
 
 		 484 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  38.7 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  38.21 
 
 		 311 aa  179  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  38.7 
 
 		 284 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  37.58 
 
 		 297 aa  175  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  39.93 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 		 281 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  40.43 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  37.68 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  36.24 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  39.21 
 
 		 277 aa  169  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  40.42 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  37.94 
 
 		 280 aa  165  9e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  38.26 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  41.16 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  37.11 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  35.59 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  32.12 
 
 		 341 aa  123  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  30.25 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  29.93 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  53.51 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  28.11 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  28.43 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  41.91 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  34.78 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  49.11 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  35.69 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  45.24 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.04 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  43.57 
 
 		 268 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  39.1 
 
 		 282 aa  105  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  44.2 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  48.21 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  43.88 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  30.04 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  45.24 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  48.21 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  31.85 
 
 		 303 aa  103  5e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 		 259 aa  103  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  45.08 
 
 		 287 aa  103  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  45.53 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  31.94 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  43.97 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  31.94 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  31.94 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  32.04 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  32.23 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  30.86 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  30.13 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 		 271 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  31.18 
 
 		 285 aa  99  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  39.06 
 
 		 271 aa  99  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  44.8 
 
 		 260 aa  99  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  34.3 
 
 		 280 aa  99  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl286  CDP-diglyceride synthetase  44.96 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989718  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  31.28 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  42.74 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  42.06 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  49.53 
 
 		 280 aa  98.2  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  48.62 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  32.04 
 
 		 286 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  31.25 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  44 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  39.44 
 
 		 242 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  31.64 
 
 		 252 aa  97.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  41.22 
 
 		 233 aa  97.4  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  42.37 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  37.88 
 
 		 260 aa  97.4  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  46.85 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  39.37 
 
 		 267 aa  96.7  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0961  phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 		 283 aa  96.7  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 		 269 aa  96.3  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  36.49 
 
 		 265 aa  96.3  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  38.4 
 
 		 265 aa  96.3  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  43.55 
 
 		 275 aa  96.3  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  40.46 
 
 		 284 aa  96.3  6e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  41.23 
 
 		 277 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>