More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0138 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  100 
 
 
608 aa  1221    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  43.81 
 
 
597 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  47.79 
 
 
598 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  44.64 
 
 
502 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  40.77 
 
 
957 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  40.17 
 
 
926 aa  382  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  39.82 
 
 
925 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  39.5 
 
 
925 aa  382  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  39 
 
 
609 aa  353  5e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  42.89 
 
 
598 aa  347  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  42.67 
 
 
598 aa  347  5e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  41.14 
 
 
596 aa  345  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  42 
 
 
589 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  41.36 
 
 
583 aa  344  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  41.65 
 
 
588 aa  341  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  40.91 
 
 
596 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  42.76 
 
 
589 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  42.3 
 
 
504 aa  339  9.999999999999999e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  42.83 
 
 
593 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  41.59 
 
 
596 aa  337  5e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  37.52 
 
 
591 aa  335  2e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  40 
 
 
596 aa  334  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.38 
 
 
457 aa  333  4e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  42.48 
 
 
591 aa  333  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  42.16 
 
 
596 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  39.65 
 
 
464 aa  331  3e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  41.72 
 
 
596 aa  330  4e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  40.32 
 
 
596 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  42.04 
 
 
597 aa  330  6e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  41.94 
 
 
596 aa  329  9e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  42.01 
 
 
596 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  42.01 
 
 
596 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  42.01 
 
 
596 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  42.01 
 
 
596 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  41.72 
 
 
596 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  41.7 
 
 
589 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  38.57 
 
 
599 aa  324  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  37.3 
 
 
584 aa  321  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  38.43 
 
 
582 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  37.48 
 
 
582 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.22 
 
 
465 aa  310  4e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  36.59 
 
 
582 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  37.3 
 
 
582 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  37.3 
 
 
582 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  37.5 
 
 
586 aa  301  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  37.15 
 
 
586 aa  301  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  34.74 
 
 
603 aa  300  7e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  34.65 
 
 
606 aa  297  4e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  34.2 
 
 
637 aa  295  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  36.31 
 
 
631 aa  293  4e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.2 
 
 
616 aa  293  6e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  33.27 
 
 
616 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  36.19 
 
 
605 aa  285  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  32.3 
 
 
650 aa  280  7e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  31.18 
 
 
1005 aa  258  3e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  36.12 
 
 
635 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  35.56 
 
 
627 aa  253  9.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  31.49 
 
 
1004 aa  252  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  34.42 
 
 
517 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.03 
 
 
577 aa  234  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  32.98 
 
 
668 aa  228  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  31.69 
 
 
587 aa  227  4e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  31.69 
 
 
587 aa  227  4e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10296  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05070)  36.6 
 
 
484 aa  222  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  32.91 
 
 
519 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  35.22 
 
 
515 aa  217  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  35.22 
 
 
515 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  32.55 
 
 
519 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  34.78 
 
 
515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  31.98 
 
 
519 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  33.89 
 
 
561 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  31.23 
 
 
517 aa  210  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  31.17 
 
 
659 aa  209  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  32.48 
 
 
517 aa  207  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  30.66 
 
 
510 aa  206  8e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  32.13 
 
 
517 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45689  fumarate reductase flavoprotein subunit  33.54 
 
 
478 aa  204  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  31.25 
 
 
483 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  30.74 
 
 
499 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  30.69 
 
 
515 aa  200  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  32.4 
 
 
511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  28.9 
 
 
521 aa  191  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  29.75 
 
 
500 aa  189  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.89 
 
 
534 aa  187  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  31.27 
 
 
506 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  31.81 
 
 
506 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  31.81 
 
 
506 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  30.71 
 
 
521 aa  179  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  29.2 
 
 
517 aa  179  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  30.47 
 
 
494 aa  178  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  30.88 
 
 
506 aa  177  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.75 
 
 
460 aa  177  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.8 
 
 
493 aa  177  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  29.29 
 
 
500 aa  176  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0682  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.98 
 
 
640 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305666  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  29.2 
 
 
505 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.55 
 
 
542 aa  174  5e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0344  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.24 
 
 
596 aa  174  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.24 
 
 
596 aa  173  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.65 
 
 
596 aa  173  9e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>