More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0017 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0017  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 		 247 aa  495  1e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000429816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2399  protein of unknown function UPF0126  38.46 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.53799 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2715  protein of unknown function UPF0126  32.19 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4671  protein of unknown function UPF0126  33.48 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0543686  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04050  predicted membrane protein  30.3 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.818037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  40.85 
 
 		 218 aa  111  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1699  protein of unknown function UPF0126  32.83 
 
 		 218 aa  99.4  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0237886  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  33.67 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  31.28 
 
 		 205 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1144  hypothetical protein  32.16 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.422721  normal  0.397537 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  28.57 
 
 		 203 aa  95.5  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  30.77 
 
 		 205 aa  95.5  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2740  protein of unknown function UPF0126  35.1 
 
 		 225 aa  95.1  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  32.28 
 
 		 207 aa  95.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  33.85 
 
 		 211 aa  92.4  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  31.98 
 
 		 211 aa  92.4  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0647  protein of unknown function UPF0126  30.05 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  37.74 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  32.16 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  31.16 
 
 		 206 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18070  predicted membrane protein  29.74 
 
 		 258 aa  89.7  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  31.55 
 
 		 206 aa  90.1  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  32.47 
 
 		 203 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3086  protein of unknown function UPF0126  32.09 
 
 		 222 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  38.75 
 
 		 219 aa  89  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  31.53 
 
 		 201 aa  88.6  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  30.81 
 
 		 238 aa  88.6  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  28.8 
 
 		 211 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  39.16 
 
 		 216 aa  88.2  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  36.14 
 
 		 208 aa  88.2  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2426  hypothetical protein  33.67 
 
 		 207 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4861  hypothetical protein  32 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1035  protein of unknown function UPF0126  31.47 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  31.47 
 
 		 207 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  29.95 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0832  hypothetical protein  32.16 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0844  hypothetical protein  32.16 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0933  hypothetical protein  33.5 
 
 		 207 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0493  hypothetical protein  33.5 
 
 		 207 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179454  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  29.41 
 
 		 207 aa  86.3  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0972  hypothetical protein  33.5 
 
 		 207 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1030  protein of unknown function UPF0126  38.62 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  31.93 
 
 		 209 aa  86.3  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3482  hypothetical protein  31.61 
 
 		 202 aa  86.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4075  hypothetical protein  33.5 
 
 		 207 aa  85.9  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.737664  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5275  hypothetical protein  34.38 
 
 		 210 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0471034  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  35.76 
 
 		 204 aa  85.5  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3127  hypothetical protein  33.52 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  31.47 
 
 		 206 aa  85.1  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2951  hypothetical protein  30.26 
 
 		 217 aa  85.1  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184845 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5672  hypothetical protein  33.85 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5518  hypothetical protein  33.85 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  38.36 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3187  protein of unknown function UPF0126  33.73 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.120724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5216  hypothetical protein  33.85 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5551  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000978127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5603  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5102  permease  33.33 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00494351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5119  permease  33.33 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0584  hypothetical protein  29.56 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2988  hypothetical protein  32.34 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00741318  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  32.07 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1555  protein of unknown function UPF0126  29.21 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.283277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20410  predicted membrane protein  30.43 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0632  hypothetical protein  29.8 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3616  hypothetical protein  30.16 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5404  hypothetical protein  32.81 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5547  hypothetical protein  32.81 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3937  hypothetical protein  32.29 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000127693  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  34.87 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  28.79 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01709  hypothetical protein  28.76 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0180886  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  35.37 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  30.35 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  30.43 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  29.85 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1950  protein of unknown function UPF0126  34.01 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.791374  hitchhiker  0.00643781 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  31.22 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2079  protein of unknown function UPF0126  32.53 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  35.37 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  28.21 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  30.65 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  35.37 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  26.96 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  34.34 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  30.15 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0787  hypothetical protein  36.36 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181124  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2125  hypothetical protein  36.36 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.255131  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0870  hypothetical protein  32.11 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1175  hypothetical protein  34.9 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1993  hypothetical protein  36.36 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2619  hypothetical protein  36.36 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  27.86 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2993  hypothetical protein  36.36 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3081  hypothetical protein  36.36 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2344  hypothetical protein  29.85 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.740415  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1558  yadS protein  35.58 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0785  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  30.15 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>