More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6782 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6782  ABC transporter related  100 
 
 		 225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3844  ABC transporter related protein  71.62 
 
 		 225 aa  320  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02440  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  73.83 
 
 		 227 aa  319  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0302  ABC transporter related protein  75.23 
 
 		 228 aa  313  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3473  ABC transporter related protein  69.77 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0812  ABC transporter related  64.68 
 
 		 228 aa  275  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  66.82 
 
 		 238 aa  275  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3828  ABC transporter related  64.52 
 
 		 226 aa  263  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0596278  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  62.79 
 
 		 228 aa  261  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0526  ABC transporter related  61.64 
 
 		 237 aa  261  6e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7376  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component-like protein  60.37 
 
 		 280 aa  251  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  59.43 
 
 		 305 aa  242  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5553  ABC transporter related protein  56.34 
 
 		 258 aa  241  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.66 
 
 		 280 aa  227  9e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1342  ABC transporter related  58.8 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1611  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  52.94 
 
 		 357 aa  223  3e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.95 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  57.48 
 
 		 233 aa  211  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.52 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.02 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.602292  normal  0.126496 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4160  ABC transporter related  58.41 
 
 		 229 aa  205  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2822  ABC transporter related protein  52.91 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.794487  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3127  ABC transporter related protein  57.01 
 
 		 289 aa  198  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0957069  decreased coverage  0.0000103375 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  40.99 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.75 
 
 		 230 aa  184  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  44.24 
 
 		 225 aa  184  7e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  44.24 
 
 		 225 aa  184  7e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  47.71 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  45.27 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  40.62 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2233  ABC-type lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.18 
 
 		 201 aa  181  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  42.72 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  44.5 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  42.25 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  44.8 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  47.91 
 
 		 262 aa  179  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  49.26 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  50 
 
 		 247 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  45.18 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  41.1 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  43.75 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 		 227 aa  178  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2110  ABC transporter related protein  41.82 
 
 		 257 aa  178  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  48.39 
 
 		 244 aa  177  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  48.78 
 
 		 252 aa  177  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  41.2 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.452379 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  44.28 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  40.85 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  47.53 
 
 		 258 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  42.72 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2599  ABC transporter related  44.74 
 
 		 232 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215852  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  47.32 
 
 		 250 aa  175  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0341  ABC transporter related  39.63 
 
 		 226 aa  175  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.7 
 
 		 236 aa  175  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  47.55 
 
 		 264 aa  175  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.91 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.91 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.28 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 		 227 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.28 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.28 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.28 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  48.51 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.34 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  46.92 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 		 240 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 		 240 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1616  ABC transporter related protein  44.5 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.16 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  45.09 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0833  ABC transporter related  42.2 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  42.99 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2863  ABC transporter related  43.42 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479401  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.91 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.16 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  37.84 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  43.78 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.32 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 		 248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.78 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  43.78 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  46.67 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1387  ABC transporter related protein  39.81 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  46.85 
 
 		 243 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 226 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  42.86 
 
 		 237 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  38.18 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  47.74 
 
 		 291 aa  171  7.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.78 
 
 		 233 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  46.19 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  46.19 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0941  ATP binding protein of ABC transporter  43.84 
 
 		 218 aa  171  9e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000194458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.05 
 
 		 245 aa  171  9e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>