162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4931 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4931  sodium/sulphate symporter  100 
 
 		 486 aa  909    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4560  sodium/sulphate symporter  43.62 
 
 		 555 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.760965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  30.82 
 
 		 473 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  31.26 
 
 		 476 aa  254  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  31.04 
 
 		 476 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  31.04 
 
 		 476 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  28.61 
 
 		 489 aa  139  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  26.11 
 
 		 493 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  24.8 
 
 		 533 aa  97.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  25.27 
 
 		 532 aa  97.1  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  25.15 
 
 		 568 aa  97.1  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  25.71 
 
 		 483 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  26.77 
 
 		 422 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  26.77 
 
 		 422 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  26.77 
 
 		 422 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  27.49 
 
 		 422 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  25.75 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  25.45 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  26.22 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  25.74 
 
 		 458 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  23.81 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  22.76 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  25.11 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  25.51 
 
 		 516 aa  73.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  25.77 
 
 		 498 aa  73.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1909  sodium/sulphate symporter  28.37 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1359  anion transporter  24.93 
 
 		 534 aa  72.4  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  25.81 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  23.63 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2456  sodium/sulphate symporter  25.75 
 
 		 463 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2340  sodium/sulphate symporter  25.65 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2351  sodium/sulphate symporter  25.35 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.9001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1868  sodium/sulphate symporter  24.01 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  29.63 
 
 		 483 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  25.27 
 
 		 518 aa  65.9  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2007  sodium/sulphate symporter  26.88 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568868 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0639  putative membrane transporter  27.73 
 
 		 570 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  22.75 
 
 		 513 aa  65.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3450  anion transporter  28.49 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502589  normal  0.0319564 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4275  sodium/sulphate symporter  28.31 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43990  sodium/solute symporter protein  26.23 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  25.26 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2111  sodium/sulphate symporter  27.34 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  23.69 
 
 		 482 aa  64.3  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  30.82 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  24.62 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  25.35 
 
 		 514 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1851  sodium/sulphate symporter  22.78 
 
 		 521 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1922  sodium/sulphate symporter  26.98 
 
 		 462 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1872  sodium/sulphate symporter  24.19 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3599  sodium/sulphate symporter  27.38 
 
 		 441 aa  62  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.914538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1867  sodium/sulphate symporter  26.62 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.970119  normal  0.269593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  23.41 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4053  sodium/sulphate symporter  28.06 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  25.19 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  22.46 
 
 		 557 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  23.27 
 
 		 507 aa  59.3  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  27.8 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  22.87 
 
 		 531 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5900  sodium/sulphate symporter  29.29 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.020602 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  21.5 
 
 		 485 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5677  sodium/sulphate symporter  29.29 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0143035  normal  0.0333919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  25.77 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  23.61 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01839  sulfur deprivation response regulator  31.17 
 
 		 620 aa  57  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379301  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0892  anion transporter  24 
 
 		 422 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0860  anion transporter  24 
 
 		 422 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.918843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0801  anion transporter  24 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0829  anion transporter  24 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0506  di- and tricarboxylate transporter  24.24 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  24.18 
 
 		 517 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  24.18 
 
 		 517 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  25.77 
 
 		 486 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  20.61 
 
 		 487 aa  56.2  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3192  TrkA-C domain protein  31.72 
 
 		 615 aa  56.6  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.213915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  26.04 
 
 		 475 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  22.58 
 
 		 487 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  30.23 
 
 		 505 aa  55.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  24.32 
 
 		 476 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  22.74 
 
 		 474 aa  54.7  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  28.25 
 
 		 607 aa  54.7  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  24.32 
 
 		 487 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  24.32 
 
 		 487 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2041  sodium/sulphate symporter  23.28 
 
 		 488 aa  54.3  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341922  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  24.32 
 
 		 487 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  24.32 
 
 		 487 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  24.32 
 
 		 487 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  24.32 
 
 		 487 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  24.08 
 
 		 543 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  24.51 
 
 		 510 aa  53.9  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  22.58 
 
 		 487 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  25.93 
 
 		 609 aa  53.5  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  25.79 
 
 		 483 aa  53.5  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  22.33 
 
 		 487 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3891  sodium/sulphate symporter  27.08 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  25.16 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  23.55 
 
 		 489 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  22.33 
 
 		 487 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  23.08 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  24.12 
 
 		 456 aa  52.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>