158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4592 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 408 aa  767    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 433 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  35.66 
 
 		 412 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8042  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 417 aa  90.5  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  29.4 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4186  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0605238  normal  0.40114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  25.26 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  25.26 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.742422 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  25.26 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  25.26 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4647  hypothetical protein  32.16 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  28.31 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  28.31 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  28.31 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2064  multidrug resistance protein MdtH  25.9 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182289 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01061  predicted drug efflux system  25.63 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2581  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 450 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01069  hypothetical protein  25.63 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1188  multidrug resistance protein MdtH  25.63 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2261  multidrug resistance protein MdtH  25.63 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  25 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1444  multidrug resistance protein MdtH  25.9 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723421  hitchhiker  0.006681 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1188  multidrug resistance protein MdtH  25.63 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.812353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2535  multidrug resistance protein MdtH  25.63 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  normal  0.203452 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1579  multidrug resistance protein MdtH  25.98 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  26.65 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1802  multidrug resistance protein MdtH  26.79 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2079  multidrug resistance protein MdtH  26.79 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0994516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  22.46 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  22.52 
 
 		 423 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  27.3 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  22.94 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  22.94 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  22.94 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  22.94 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7065  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  22.46 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  21.6 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  22.87 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  22.22 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3662  hypothetical protein  27.72 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2276  multidrug resistance protein MdtH  26.19 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  21.41 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  21.6 
 
 		 423 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  21.47 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3638  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205021  decreased coverage  0.00774423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4463  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1225  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  27.33 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2239  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181769  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4522  hypothetical protein  26.37 
 
 		 427 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  23.32 
 
 		 423 aa  67  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4929  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127537  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0239  multidrug resistance protein MdtH  24.1 
 
 		 411 aa  62.8  0.000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15780  Major Facilitator Superfamily transporter  27.03 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.475772  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  19.58 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  19.58 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  22.49 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  19.31 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  19.31 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  19.31 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  19.31 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  22.76 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  26.37 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  21.65 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  21.65 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  21.65 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  18.78 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  28.57 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  19.63 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  24.86 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  25.13 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0418  hypothetical protein  27.84 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3966  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 1075 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1065  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.137002  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2674  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3758  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 		 418 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0163  major facilitator transporter  19.88 
 
 		 416 aa  54.3  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 435 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4177  hypothetical protein  30.94 
 
 		 189 aa  53.5  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 426 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 433 aa  53.1  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  21.41 
 
 		 412 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>