More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2672 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2672  LigA  100 
 
 		 200 aa  398  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3347  methyltransferase type 12  68 
 
 		 201 aa  259  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.84561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  65.5 
 
 		 201 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  64.29 
 
 		 423 aa  238  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  61.31 
 
 		 201 aa  234  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  59.6 
 
 		 199 aa  222  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  59.2 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3123  MCP methyltransferase, CheR-type  60.61 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  57.71 
 
 		 201 aa  214  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  58 
 
 		 201 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  58 
 
 		 201 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  58 
 
 		 201 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  60.22 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  54.27 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  53.33 
 
 		 200 aa  190  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5057  Methyltransferase type 12  54.5 
 
 		 201 aa  174  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  50.75 
 
 		 203 aa  174  9e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4368  Methyltransferase type 12  50.27 
 
 		 192 aa  157  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  51.83 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  43.64 
 
 		 259 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  43.94 
 
 		 195 aa  118  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  36.09 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2162  hypothetical protein  31.61 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0386731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  37.5 
 
 		 246 aa  57.8  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  32.35 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  43.18 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  27.49 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  39.76 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 996 aa  55.1  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 264 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.24 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 267 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  26.19 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  47.62 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  26.15 
 
 		 296 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  28.38 
 
 		 541 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  28.38 
 
 		 541 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  27.59 
 
 		 275 aa  52.8  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.82 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  40.26 
 
 		 236 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.82 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  28.38 
 
 		 541 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  28.38 
 
 		 541 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  43.06 
 
 		 258 aa  52  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  27.04 
 
 		 247 aa  52  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  44.68 
 
 		 254 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 259 aa  51.6  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.37 
 
 		 233 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 260 aa  51.6  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  41.79 
 
 		 232 aa  51.6  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  28.57 
 
 		 237 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  41.86 
 
 		 225 aa  51.2  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 309 aa  51.6  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  40.91 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  38 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.09 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  27.7 
 
 		 541 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2180  putative methyltransferase  52.08 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  30.17 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 		 249 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3562  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.50395 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.71 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  27.14 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.5 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  39.77 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  28.47 
 
 		 390 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  35.8 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  37.29 
 
 		 305 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.5 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.11 
 
 		 243 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  33.87 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  32.46 
 
 		 258 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  39.29 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  38.1 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  52 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  52.83 
 
 		 248 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 223 aa  48.9  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  34.52 
 
 		 429 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 243 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.5 
 
 		 233 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.01 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 250 aa  48.5  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4504  methyltransferase type 12  33.1 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210014  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 249 aa  48.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.61 
 
 		 250 aa  48.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  45.16 
 
 		 244 aa  48.1  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>