204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2438 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  100 
 
 		 405 aa  799    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  51.41 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  47.31 
 
 		 411 aa  293  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  44.02 
 
 		 416 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  48.26 
 
 		 425 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  47.7 
 
 		 416 aa  273  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  42.04 
 
 		 423 aa  273  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  45.31 
 
 		 416 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  44.63 
 
 		 449 aa  271  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  42.35 
 
 		 416 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  48.99 
 
 		 429 aa  268  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  42.35 
 
 		 416 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  45.17 
 
 		 416 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  45.17 
 
 		 416 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  42.13 
 
 		 416 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  43.47 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  42.45 
 
 		 411 aa  260  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  45.78 
 
 		 418 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  45.24 
 
 		 412 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  43.04 
 
 		 408 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  44.88 
 
 		 430 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  38.05 
 
 		 407 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  43 
 
 		 419 aa  241  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  37.75 
 
 		 416 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  40 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  38.35 
 
 		 410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  36.99 
 
 		 434 aa  224  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  43.03 
 
 		 412 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  40.86 
 
 		 429 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  35.94 
 
 		 404 aa  216  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  36.1 
 
 		 416 aa  204  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  37.66 
 
 		 425 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  35.45 
 
 		 422 aa  193  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  31.21 
 
 		 413 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  36.72 
 
 		 422 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  31.31 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  31.31 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  31.99 
 
 		 413 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  30.64 
 
 		 432 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  30.64 
 
 		 413 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  30.64 
 
 		 413 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  30.64 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  30.3 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  30.64 
 
 		 432 aa  177  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  31.14 
 
 		 413 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  34.45 
 
 		 418 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  33.94 
 
 		 418 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  33.94 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  34.13 
 
 		 410 aa  170  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  30.08 
 
 		 436 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  31.33 
 
 		 420 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  32.14 
 
 		 394 aa  143  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  33.43 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  31.63 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  28.62 
 
 		 398 aa  136  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  29.77 
 
 		 398 aa  136  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  29.77 
 
 		 398 aa  136  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.21 
 
 		 465 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  29.12 
 
 		 464 aa  133  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  32.28 
 
 		 413 aa  130  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  25 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  34.72 
 
 		 448 aa  126  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  27.4 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  33.1 
 
 		 513 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.44 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  26.85 
 
 		 407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.84 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  27.24 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  30.32 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  30.49 
 
 		 376 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  29.26 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  21.97 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  25.52 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  25.91 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  21.35 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  19.76 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  28.74 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  25 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  25.36 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  27.02 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  25.68 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  24.38 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  24.38 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  22.74 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  24.38 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  24.58 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  27.87 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  26.42 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  25.33 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  25.52 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  19.11 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  22.78 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1255  metallophosphoesterase  24.44 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.232414 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  25.19 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1060  DNA repair exonuclease  26.58 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00537439  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  23.4 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2463  metallophosphoesterase  28.21 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  22.66 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  26.01 
 
 		 392 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  19.35 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>