More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0060 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  646    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  78.95 
 
 		 343 aa  496  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  59.69 
 
 		 332 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  60.2 
 
 		 327 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  52 
 
 		 327 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  47.53 
 
 		 327 aa  299  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  47.62 
 
 		 349 aa  292  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  46.67 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  46.67 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  48.1 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  48.32 
 
 		 324 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  48.82 
 
 		 314 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  49.5 
 
 		 325 aa  288  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  46.15 
 
 		 326 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  46.8 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  46.71 
 
 		 330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  46.46 
 
 		 328 aa  286  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  48.36 
 
 		 325 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  46.98 
 
 		 330 aa  286  5e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  47.65 
 
 		 328 aa  285  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  47.11 
 
 		 339 aa  285  8e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  47.12 
 
 		 328 aa  285  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  46.71 
 
 		 355 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  49.53 
 
 		 333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  48.18 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  45.54 
 
 		 331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  47.81 
 
 		 339 aa  282  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  47.72 
 
 		 353 aa  282  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  45.23 
 
 		 331 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  49 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  50.67 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  48.04 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  45.65 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  47.65 
 
 		 338 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  46.64 
 
 		 325 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  47.49 
 
 		 325 aa  279  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  46.04 
 
 		 330 aa  279  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  48.01 
 
 		 333 aa  279  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  47.02 
 
 		 349 aa  278  7e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  45.65 
 
 		 328 aa  278  9e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  46.8 
 
 		 327 aa  278  9e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  46.8 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  47.37 
 
 		 310 aa  277  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  44.78 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  49.5 
 
 		 323 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  46.18 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  46.49 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  45.97 
 
 		 331 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  47.19 
 
 		 358 aa  275  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  46.36 
 
 		 335 aa  275  8e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  44.63 
 
 		 323 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  46.31 
 
 		 304 aa  275  8e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.09 
 
 		 331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  46.13 
 
 		 337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  45.79 
 
 		 330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  47.64 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  47.49 
 
 		 328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  44.03 
 
 		 321 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  44.51 
 
 		 321 aa  272  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  44.78 
 
 		 330 aa  272  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  45.13 
 
 		 325 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  44.27 
 
 		 323 aa  271  9e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  44.97 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  44.06 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  43.08 
 
 		 335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  45.6 
 
 		 326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  45.92 
 
 		 335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  44 
 
 		 321 aa  269  5e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  47.24 
 
 		 335 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  45.64 
 
 		 322 aa  268  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  45.22 
 
 		 327 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  45.57 
 
 		 345 aa  268  8e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  45.57 
 
 		 345 aa  268  8e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1601  hypothetical protein  43.79 
 
 		 322 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0236612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  46 
 
 		 324 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  44.14 
 
 		 332 aa  267  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  45.03 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  44.34 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  43.58 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  44.16 
 
 		 320 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  44.24 
 
 		 356 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  43.69 
 
 		 324 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  45.81 
 
 		 335 aa  265  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  45.15 
 
 		 334 aa  265  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  43.14 
 
 		 326 aa  265  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  44.2 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  42.15 
 
 		 330 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  45.21 
 
 		 327 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  44.63 
 
 		 317 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.11 
 
 		 330 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  41.82 
 
 		 333 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3101  hypothetical protein  42.24 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  43.63 
 
 		 351 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  47.04 
 
 		 335 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  44.15 
 
 		 325 aa  262  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  43.83 
 
 		 334 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  45.36 
 
 		 314 aa  262  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  44.3 
 
 		 317 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  45.02 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  46.31 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>