138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1814 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  93.15 
 
 		 892 aa  1286    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 701 aa  1404    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0428  CRISPR-associated helicase Cas3  49.16 
 
 		 897 aa  619  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752021  normal  0.154756 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  45.08 
 
 		 899 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5415  CRISPR-associated helicase Cas3  44.6 
 
 		 897 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  42.79 
 
 		 906 aa  457  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  41.65 
 
 		 921 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  41.43 
 
 		 904 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  41.59 
 
 		 912 aa  426  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0224  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  41.17 
 
 		 897 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  42.31 
 
 		 892 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  41.06 
 
 		 920 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  40.59 
 
 		 887 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2889  CRISPR-associated helicase Cas3  37.68 
 
 		 899 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0793506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  40.43 
 
 		 887 aa  399  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00865  CRISPR-associated helicase Cas3  38.34 
 
 		 915 aa  395  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.798987  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  39.69 
 
 		 912 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  38.61 
 
 		 899 aa  391  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  38.29 
 
 		 885 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  38.17 
 
 		 907 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3548  CRISPR-associated helicase Cas3  37.65 
 
 		 908 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.18776 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  37.33 
 
 		 883 aa  291  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0604  hypothetical protein  44.25 
 
 		 456 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  31.85 
 
 		 888 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  33.66 
 
 		 888 aa  270  5e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  31.48 
 
 		 888 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  35.06 
 
 		 944 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  35.46 
 
 		 885 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  30.56 
 
 		 860 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  32.04 
 
 		 823 aa  236  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  32.12 
 
 		 854 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  37.8 
 
 		 927 aa  233  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  30.49 
 
 		 887 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2343  CRISPR-associated helicase Cas3  33.61 
 
 		 879 aa  226  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  34.24 
 
 		 905 aa  223  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  34.74 
 
 		 970 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  34.18 
 
 		 854 aa  221  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2438  CRISPR-associated helicase Cas3  32.17 
 
 		 908 aa  221  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2679  CRISPR-associated helicase Cas3  35.76 
 
 		 965 aa  220  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000878559  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  36.44 
 
 		 899 aa  219  8.999999999999998e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  31.95 
 
 		 837 aa  218  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0480  CRISPR-associated helicase Cas3  34.46 
 
 		 868 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227979  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  33.23 
 
 		 887 aa  217  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  36 
 
 		 929 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0955  CRISPR-associated helicase Cas3  34.66 
 
 		 871 aa  213  9e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  31.43 
 
 		 948 aa  213  1e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  33.23 
 
 		 971 aa  211  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1593  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  31.8 
 
 		 944 aa  208  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0156673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  34.05 
 
 		 901 aa  207  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  34.36 
 
 		 1540 aa  203  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  36.73 
 
 		 968 aa  201  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0936  CRISPR-associated helicase Cas3  33.06 
 
 		 881 aa  198  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  31.65 
 
 		 860 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0912  CRISPR-associated helicase Cas3  29.41 
 
 		 871 aa  197  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2228  CRISPR-associated helicase Cas3  32.88 
 
 		 876 aa  193  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229037  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  35.93 
 
 		 919 aa  193  8e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0340  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  33.94 
 
 		 885 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  35.09 
 
 		 922 aa  192  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  36.01 
 
 		 888 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  32.62 
 
 		 594 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3055  CRISPR-associated helicase Cas3  33.96 
 
 		 918 aa  184  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107976  hitchhiker  0.000610459 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3214  cas3: CRISPR-associated helicase Cas3  32.14 
 
 		 857 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  32.27 
 
 		 933 aa  182  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2572  CRISPR-associated helicase Cas3  34.14 
 
 		 986 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  30.8 
 
 		 832 aa  172  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17360  CRISPR-associated helicase Cas3  31.27 
 
 		 943 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  31.19 
 
 		 962 aa  148  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  25.66 
 
 		 750 aa  114  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  27.23 
 
 		 750 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  31.51 
 
 		 729 aa  110  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  27.58 
 
 		 762 aa  107  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  24.51 
 
 		 737 aa  105  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  27.02 
 
 		 763 aa  106  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  29.43 
 
 		 795 aa  104  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  28.3 
 
 		 917 aa  101  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  26.62 
 
 		 778 aa  98.6  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  28.61 
 
 		 827 aa  97.8  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  23.26 
 
 		 741 aa  96.3  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  24.66 
 
 		 736 aa  94  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  26.37 
 
 		 741 aa  93.6  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  28.5 
 
 		 779 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  29.11 
 
 		 781 aa  92.4  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  27.55 
 
 		 804 aa  91.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  28.49 
 
 		 783 aa  90.5  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  28.61 
 
 		 1027 aa  89.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  25.39 
 
 		 726 aa  89.7  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  22.84 
 
 		 764 aa  85.1  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  28.5 
 
 		 801 aa  84  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  25 
 
 		 744 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  25.19 
 
 		 775 aa  79.7  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  25.13 
 
 		 729 aa  78.6  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  29.53 
 
 		 566 aa  76.6  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  28.03 
 
 		 799 aa  76.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  28.8 
 
 		 850 aa  75.5  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  28.21 
 
 		 811 aa  74.7  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  22.3 
 
 		 807 aa  72  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1639  CRISPR-associated helicase Cas3  28.39 
 
 		 791 aa  67  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.6 
 
 		 724 aa  63.9  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  22.81 
 
 		 492 aa  62.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  20.39 
 
 		 800 aa  61.6  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>