More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1362 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1362  ABC transporter related  100 
 
 		 617 aa  1211    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  55.83 
 
 		 630 aa  626  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  54.9 
 
 		 663 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  56.17 
 
 		 643 aa  623  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  55.83 
 
 		 623 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  54.72 
 
 		 636 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  55.48 
 
 		 621 aa  618  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  54.22 
 
 		 587 aa  608  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  55.07 
 
 		 637 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0417  ABC transporter related  53.86 
 
 		 587 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  55.24 
 
 		 637 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  55.42 
 
 		 609 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  55.24 
 
 		 637 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  55.65 
 
 		 621 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  55.65 
 
 		 621 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  55.65 
 
 		 621 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  55.65 
 
 		 621 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  55.65 
 
 		 621 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  55.07 
 
 		 637 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  55.65 
 
 		 621 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6620  ABC transporter related  53.79 
 
 		 587 aa  601  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00971242  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  56.38 
 
 		 589 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7369  ABC transporter related  53.62 
 
 		 587 aa  598  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0594477  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0327  ABC transporter, transmembrane region  55.05 
 
 		 587 aa  593  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3443  ABC transporter related  52.45 
 
 		 588 aa  585  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3122  ABC transporter related  52.45 
 
 		 588 aa  585  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3319  ABC transporter related  52.27 
 
 		 588 aa  587  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0505  ABC transporter related  54.55 
 
 		 599 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.555752  normal  0.0162787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1142  ABC transporter related  54.66 
 
 		 585 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4748  ABC transporter related  51.9 
 
 		 611 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  50.87 
 
 		 589 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3210  ABC transporter related  54.18 
 
 		 587 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.461099  normal  0.871675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4750  ABC transporter related  51.92 
 
 		 611 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0785549  normal  0.275934 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  45.44 
 
 		 591 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  44.56 
 
 		 599 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  43.04 
 
 		 587 aa  458  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0085  ABC transporter related  43.48 
 
 		 604 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  33.45 
 
 		 633 aa  352  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  32.58 
 
 		 610 aa  333  6e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  32.76 
 
 		 610 aa  329  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  30.85 
 
 		 603 aa  317  4e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0665  ABC transporter related  39.19 
 
 		 646 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.308501 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3410  ABC transporter related  34.36 
 
 		 638 aa  315  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0677  ABC transporter related  39.19 
 
 		 618 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.0281361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  39.76 
 
 		 600 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  32.27 
 
 		 593 aa  313  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  32.71 
 
 		 599 aa  313  4.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  30.68 
 
 		 603 aa  313  5.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  32.32 
 
 		 594 aa  313  7.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  37.74 
 
 		 601 aa  310  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0644  ABC transporter related  38.99 
 
 		 646 aa  310  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.601366 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  36.11 
 
 		 613 aa  310  5e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3491  ATPase  36.15 
 
 		 614 aa  310  5.9999999999999995e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5011  ABC transporter related  37.68 
 
 		 601 aa  309  9e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2892  ABC transporter related  39.26 
 
 		 612 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  33.8 
 
 		 597 aa  308  3e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2091  hypothetical protein  33.86 
 
 		 598 aa  306  6e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3213  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.83 
 
 		 619 aa  306  6e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2080  hypothetical protein  33.66 
 
 		 598 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0083  ABC transporter related  37.55 
 
 		 619 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2185  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.97 
 
 		 617 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3490  ATPase  39.26 
 
 		 614 aa  302  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0731  hypothetical protein  31.55 
 
 		 582 aa  302  1e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2782  ABC transporter related  36.79 
 
 		 618 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.292223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7080  ABC transporter related  35.41 
 
 		 621 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161763  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  37.85 
 
 		 599 aa  301  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1260  hypothetical protein  31.35 
 
 		 582 aa  300  4e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.678722 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  36.35 
 
 		 617 aa  300  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  37.94 
 
 		 595 aa  300  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  36.71 
 
 		 624 aa  300  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6186  multidrug ABC transporter ATPase/permease  42.6 
 
 		 605 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  34.85 
 
 		 607 aa  299  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2865  ABC transporter related  37.07 
 
 		 614 aa  299  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.98 
 
 		 598 aa  299  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00688  multidrug resistance ABC transporter ATP-binding and permease protein  36.92 
 
 		 613 aa  298  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0450616  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2579  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  35.91 
 
 		 611 aa  297  3e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000689381  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  35.71 
 
 		 624 aa  297  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  39.39 
 
 		 620 aa  297  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1204  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  36.9 
 
 		 614 aa  296  5e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494984  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0462  ABC transporter related  37.83 
 
 		 621 aa  296  6e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  39.39 
 
 		 620 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3046  ABC transporter related  36.99 
 
 		 618 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.752635 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3611  ABC transporter related  38.54 
 
 		 626 aa  295  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0739  ABC transporter related  35.42 
 
 		 613 aa  294  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327273  normal  0.0543304 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4939  ABC transporter related  36.87 
 
 		 626 aa  294  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  36.35 
 
 		 600 aa  294  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1441  ABC transporter related  35.59 
 
 		 618 aa  293  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2299  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  39.51 
 
 		 620 aa  293  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  43.1 
 
 		 581 aa  293  9e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07111  hypothetical protein  34.98 
 
 		 612 aa  292  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  36.38 
 
 		 620 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.35 
 
 		 595 aa  291  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  36.38 
 
 		 620 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  36.38 
 
 		 620 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_002978  WD0616  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  31.55 
 
 		 591 aa  290  5.0000000000000004e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.146496  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2893  ABC transporter related  39 
 
 		 614 aa  290  6e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.05 
 
 		 619 aa  289  8e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.17 
 
 		 596 aa  289  9e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  40.89 
 
 		 601 aa  289  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2240  ABC transporter related  35.39 
 
 		 626 aa  289  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>