More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3574 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  35.75 
 
 		 196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0892  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0881  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0875  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
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NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  29.12 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
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NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  28.24 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
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NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  27.91 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
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NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
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NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  31.86 
 
 		 219 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
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NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
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NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
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NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  40.21 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  26.32 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0246  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330264  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  30.21 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3444  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0261  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3760  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
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NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
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NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  20.59 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  28.38 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
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