More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2110 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2110  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
894 aa  1826    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.55 
 
 
839 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  31.37 
 
 
823 aa  323  7e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  28.92 
 
 
831 aa  314  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  29.15 
 
 
887 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  29.27 
 
 
866 aa  296  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  28.71 
 
 
857 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  29.37 
 
 
870 aa  276  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3722  hypothetical protein  29.39 
 
 
895 aa  275  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265869  normal  0.601443 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  28.82 
 
 
832 aa  257  8e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  27.86 
 
 
832 aa  255  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  29.33 
 
 
881 aa  248  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  26 
 
 
913 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  27.23 
 
 
966 aa  243  7.999999999999999e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3540  Beta-glucosidase  27.9 
 
 
816 aa  243  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  28.29 
 
 
902 aa  242  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.04 
 
 
1072 aa  215  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  26.86 
 
 
886 aa  213  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  26.98 
 
 
898 aa  204  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  25.72 
 
 
882 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  40.83 
 
 
731 aa  201  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.9 
 
 
933 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  39.24 
 
 
731 aa  197  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  30.19 
 
 
897 aa  197  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  38.54 
 
 
922 aa  197  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  43.72 
 
 
693 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  38.54 
 
 
731 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  38.21 
 
 
733 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  25.48 
 
 
882 aa  196  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  37.86 
 
 
733 aa  194  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2328  beta-glucosidase  38.54 
 
 
302 aa  194  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.660208  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1703  putative beta-glucosidase  38.54 
 
 
375 aa  194  8e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.821899  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1910  putative beta-glucosidase  38.54 
 
 
375 aa  194  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  37.86 
 
 
733 aa  193  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.25 
 
 
757 aa  193  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  37.86 
 
 
733 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  37.86 
 
 
733 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  35.08 
 
 
987 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  39.58 
 
 
733 aa  191  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  38.75 
 
 
733 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  27.34 
 
 
988 aa  184  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2327  beta-glucosidase  41.16 
 
 
549 aa  184  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268142  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.09 
 
 
1158 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1704  beta-glucosidase  40.79 
 
 
380 aa  183  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1911  beta-glucosidase  40.79 
 
 
380 aa  183  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  25.21 
 
 
864 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  32.84 
 
 
819 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  24.89 
 
 
972 aa  182  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  42.32 
 
 
748 aa  181  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  27.71 
 
 
845 aa  181  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  40.57 
 
 
914 aa  179  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  32.88 
 
 
745 aa  178  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.57 
 
 
711 aa  177  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  39.75 
 
 
915 aa  177  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  41.77 
 
 
748 aa  177  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  30.47 
 
 
735 aa  174  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10482  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  32.38 
 
 
868 aa  174  7.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.584678 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04102  beta-glucosidase (Eurofung)  41.64 
 
 
854 aa  173  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.62 
 
 
749 aa  172  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.66 
 
 
746 aa  172  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.62 
 
 
758 aa  172  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.74 
 
 
814 aa  171  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  37.41 
 
 
691 aa  172  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.37 
 
 
820 aa  171  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.07 
 
 
755 aa  171  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  41.89 
 
 
927 aa  169  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  37.59 
 
 
762 aa  170  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  32.95 
 
 
737 aa  169  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2625  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  39.09 
 
 
820 aa  169  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416366  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  30.3 
 
 
829 aa  169  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  31.87 
 
 
822 aa  167  6.9999999999999995e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  35.34 
 
 
755 aa  167  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  30.28 
 
 
730 aa  167  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.05 
 
 
790 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  37.29 
 
 
772 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  38.74 
 
 
731 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  38.82 
 
 
1338 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  26.32 
 
 
913 aa  165  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  38.24 
 
 
737 aa  166  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  31.37 
 
 
717 aa  164  7e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.32 
 
 
757 aa  164  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  33.17 
 
 
748 aa  163  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  33.42 
 
 
779 aa  163  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.02 
 
 
1321 aa  163  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  32.92 
 
 
751 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  32.92 
 
 
751 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  32.92 
 
 
751 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  37.35 
 
 
836 aa  162  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6130  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.73 
 
 
813 aa  160  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369131  decreased coverage  0.00080917 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  34.53 
 
 
737 aa  160  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  38.31 
 
 
760 aa  158  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.91 
 
 
751 aa  158  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  38.33 
 
 
738 aa  158  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  33.96 
 
 
685 aa  158  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  38.19 
 
 
913 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.82 
 
 
734 aa  157  6e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  37.85 
 
 
897 aa  157  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  37.7 
 
 
750 aa  157  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  31.6 
 
 
716 aa  157  9e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  35.93 
 
 
906 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.104106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>