203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0321 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 375 aa  769    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  55.8 
 
 		 368 aa  413  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  56.03 
 
 		 384 aa  402  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  51.91 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  53.33 
 
 		 387 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  52.5 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  51.47 
 
 		 382 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  53.82 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  48.84 
 
 		 380 aa  364  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  50.14 
 
 		 392 aa  362  6e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  52.1 
 
 		 355 aa  358  9e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  50.54 
 
 		 382 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  50.84 
 
 		 388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  50 
 
 		 382 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  50.13 
 
 		 390 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  49.87 
 
 		 387 aa  351  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  54.94 
 
 		 390 aa  351  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  50 
 
 		 414 aa  351  1e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  49.62 
 
 		 390 aa  348  7e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  47.81 
 
 		 387 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  47.81 
 
 		 387 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  52.62 
 
 		 321 aa  343  2e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  49.86 
 
 		 387 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  50.98 
 
 		 387 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  50.56 
 
 		 361 aa  332  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  50.7 
 
 		 350 aa  330  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  47.34 
 
 		 354 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  49.58 
 
 		 357 aa  325  5e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  48.45 
 
 		 392 aa  325  7e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  46.13 
 
 		 357 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  46.4 
 
 		 346 aa  322  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  46.27 
 
 		 397 aa  322  7e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  47.26 
 
 		 384 aa  322  9.000000000000001e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  46.42 
 
 		 346 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  46.69 
 
 		 346 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  47.55 
 
 		 346 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  50 
 
 		 356 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  50 
 
 		 356 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  46.2 
 
 		 356 aa  306  3e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  43.8 
 
 		 355 aa  305  6e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  46.35 
 
 		 354 aa  305  7e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  43.98 
 
 		 362 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  47.08 
 
 		 317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  43.67 
 
 		 402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  45.53 
 
 		 355 aa  300  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  43.01 
 
 		 438 aa  298  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  46.85 
 
 		 359 aa  297  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  41.87 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  45.61 
 
 		 357 aa  290  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  40.67 
 
 		 406 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  42.25 
 
 		 353 aa  289  6e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  45.38 
 
 		 347 aa  289  7e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  44.48 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  41.95 
 
 		 385 aa  283  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  42.5 
 
 		 400 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  42.7 
 
 		 356 aa  278  8e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  43.85 
 
 		 363 aa  275  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  40.61 
 
 		 360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  41.86 
 
 		 355 aa  269  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  41.08 
 
 		 372 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  42.09 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  41.39 
 
 		 371 aa  256  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  40.68 
 
 		 351 aa  253  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  40.24 
 
 		 341 aa  253  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  40.06 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  40.06 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  40.51 
 
 		 362 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  40.17 
 
 		 362 aa  245  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  40 
 
 		 361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  39.55 
 
 		 362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  40.72 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  38.89 
 
 		 362 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2369  aldose 1-epimerase  41.14 
 
 		 339 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3250  aldose 1-epimerase  36.58 
 
 		 344 aa  239  8e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  39.15 
 
 		 362 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  39.15 
 
 		 362 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  38.92 
 
 		 343 aa  237  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  38.62 
 
 		 340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  40.23 
 
 		 341 aa  233  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0693  aldose 1-epimerase  36.09 
 
 		 343 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  37.18 
 
 		 347 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0543  aldose 1-epimerase  36.9 
 
 		 343 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.386929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3579  aldose 1-epimerase  36.61 
 
 		 343 aa  230  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  41.61 
 
 		 346 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  41.61 
 
 		 346 aa  229  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  41.61 
 
 		 346 aa  229  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  41.61 
 
 		 346 aa  229  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  41.61 
 
 		 346 aa  229  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  37.68 
 
 		 346 aa  229  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  41.61 
 
 		 346 aa  229  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  40.64 
 
 		 351 aa  229  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4021  aldose 1-epimerase  35.5 
 
 		 339 aa  229  7e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000192131 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3409  aldose 1-epimerase  36.01 
 
 		 343 aa  229  7e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  39.38 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3729  aldose 1-epimerase  36.2 
 
 		 344 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0413  aldose 1-epimerase  36.69 
 
 		 342 aa  225  8e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  37.96 
 
 		 348 aa  225  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0859  aldose 1-epimerase  40.99 
 
 		 346 aa  225  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0241581  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  37.54 
 
 		 350 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0651  aldose 1-epimerase  36.01 
 
 		 343 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  hitchhiker  0.000000283833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>