187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4571 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3996  transcriptional activator domain protein  48.02 
 
 
1009 aa  766    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.306526  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4571  transcriptional activator domain protein  100 
 
 
985 aa  1962    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.723489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  29.67 
 
 
1204 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  30.38 
 
 
919 aa  104  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  31.04 
 
 
1145 aa  104  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.61 
 
 
766 aa  103  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2354  transcriptional activator domain-containing protein  28.5 
 
 
1070 aa  95.1  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.607566  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3125  transcriptional activator domain-containing protein  28.28 
 
 
1068 aa  92.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1524  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.52 
 
 
907 aa  90.1  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179507  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  22.91 
 
 
921 aa  87.4  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  21.41 
 
 
887 aa  87  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.69 
 
 
925 aa  86.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  27.37 
 
 
960 aa  84.7  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.84 
 
 
947 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2896  response regulator receiver and SARP domain-containing protein  28.51 
 
 
268 aa  82.4  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.264133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  30.61 
 
 
749 aa  81.6  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.08 
 
 
930 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  24.46 
 
 
1111 aa  80.9  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0766  tetratricopeptide TPR_4  27.95 
 
 
1000 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106648  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  24.07 
 
 
1003 aa  79.7  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  28.32 
 
 
1163 aa  80.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.89 
 
 
870 aa  79.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  25.43 
 
 
904 aa  79.3  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  27.5 
 
 
775 aa  79  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  27.75 
 
 
1108 aa  76.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.54 
 
 
922 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.55 
 
 
896 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.23 
 
 
897 aa  76.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  25.35 
 
 
1082 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.62 
 
 
1019 aa  75.5  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.85 
 
 
921 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.85 
 
 
921 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.85 
 
 
921 aa  75.5  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0954  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 
993 aa  75.1  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.656775  normal  0.653362 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  25.15 
 
 
903 aa  73.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  30.45 
 
 
919 aa  73.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  28.66 
 
 
907 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  25.15 
 
 
903 aa  73.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  29.35 
 
 
1097 aa  72.4  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  26.36 
 
 
494 aa  72  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  25.47 
 
 
1055 aa  72  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  26.11 
 
 
947 aa  72  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.38 
 
 
1021 aa  72  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  26.81 
 
 
1061 aa  70.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  25.07 
 
 
901 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0162  ATP-dependent transcriptional regulator-like  28.9 
 
 
756 aa  70.1  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  25.07 
 
 
901 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  25.13 
 
 
896 aa  69.7  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  24.71 
 
 
901 aa  69.7  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  29.7 
 
 
907 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  25.07 
 
 
901 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  25.07 
 
 
901 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  25.07 
 
 
901 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  25.07 
 
 
901 aa  69.3  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.83 
 
 
910 aa  69.7  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  25.13 
 
 
921 aa  69.3  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.31 
 
 
880 aa  69.7  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.88 
 
 
930 aa  68.9  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  26.63 
 
 
933 aa  68.9  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  27.83 
 
 
904 aa  68.6  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2887  transcriptional regulator domain protein  29.94 
 
 
997 aa  68.6  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0904649  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.87 
 
 
877 aa  68.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  24.78 
 
 
901 aa  67.8  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0766  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  29.43 
 
 
840 aa  67.4  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310851  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  25.38 
 
 
365 aa  67.8  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.08 
 
 
876 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  27.36 
 
 
907 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  24.78 
 
 
901 aa  67.8  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  27.02 
 
 
1110 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0105  transcriptional regulator domain protein  26.02 
 
 
969 aa  67  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  26 
 
 
900 aa  67  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1633  regulatory protein, LuxR  28.18 
 
 
732 aa  67  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162775 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  26.8 
 
 
905 aa  66.6  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  24.71 
 
 
824 aa  67  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  24.71 
 
 
901 aa  65.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  24.71 
 
 
901 aa  65.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1633  tetratricopeptide TPR_4  23.8 
 
 
1031 aa  66.2  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.720693  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  26.33 
 
 
921 aa  66.2  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  24.71 
 
 
901 aa  65.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  24.71 
 
 
902 aa  65.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  26.09 
 
 
896 aa  66.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  24.71 
 
 
901 aa  65.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.44 
 
 
867 aa  65.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  29.32 
 
 
1064 aa  65.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  24.32 
 
 
916 aa  65.1  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  33.96 
 
 
423 aa  64.7  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.75 
 
 
913 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.39 
 
 
905 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.3 
 
 
846 aa  63.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  26.65 
 
 
878 aa  62.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  25.75 
 
 
917 aa  62.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.47 
 
 
758 aa  62.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4809  regulatory protein, LuxR  27.14 
 
 
717 aa  62  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.17127 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  26.98 
 
 
913 aa  60.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  28.1 
 
 
1018 aa  58.9  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2176  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.94 
 
 
888 aa  58.9  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.250716 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.04 
 
 
905 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  27.49 
 
 
900 aa  59.3  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  24.36 
 
 
900 aa  58.5  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0670  regulatory protein, LuxR  27.46 
 
 
890 aa  58.5  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>