More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0353 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0353  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  670    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2501  hypothetical protein  56.68 
 
 
338 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2390  hypothetical protein  55.29 
 
 
337 aa  320  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410983  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  36.82 
 
 
337 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  30 
 
 
326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  31.02 
 
 
338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  31.05 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  31.91 
 
 
330 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  31.72 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  31.72 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  31.72 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  33.21 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4497  twin-arginine translocation pathway signal  29.94 
 
 
322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3420  hypothetical protein  32.46 
 
 
333 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4969  extra-cytoplasmic solute receptor  35.09 
 
 
364 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332662  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  32.32 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  32.35 
 
 
325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6345  hypothetical protein  34.09 
 
 
330 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  29.39 
 
 
318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2312  hypothetical protein  34.9 
 
 
330 aa  129  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3683  twin-arginine translocation pathway signal  33.45 
 
 
326 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0852906  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5205  extra-cytoplasmic solute receptor  31.16 
 
 
330 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375676  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  31.43 
 
 
329 aa  129  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  32.06 
 
 
322 aa  129  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  31.4 
 
 
326 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  31.58 
 
 
339 aa  129  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  34.57 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  30.13 
 
 
317 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3214  hypothetical protein  31.06 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  31.86 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  30.13 
 
 
317 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  32.32 
 
 
322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  31.67 
 
 
333 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  32.53 
 
 
334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  30.45 
 
 
325 aa  126  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3532  hypothetical protein  30.38 
 
 
341 aa  126  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  30.94 
 
 
351 aa  126  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3173  hypothetical protein  34.38 
 
 
328 aa  126  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  30.51 
 
 
331 aa  126  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3593  hypothetical protein  33.46 
 
 
328 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  31.03 
 
 
322 aa  125  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  30.09 
 
 
331 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  30.82 
 
 
316 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  34.2 
 
 
333 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5055  extra-cytoplasmic solute receptor  30.23 
 
 
322 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  30.82 
 
 
321 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  32.16 
 
 
316 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5610  hypothetical protein  29.04 
 
 
333 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  35.86 
 
 
356 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3165  hypothetical protein  31.87 
 
 
325 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209597  hitchhiker  0.0000237032 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3056  hypothetical protein  29.19 
 
 
332 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176831  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0430  hypothetical protein  32.31 
 
 
349 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  30.13 
 
 
326 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1641  hypothetical protein  34.4 
 
 
328 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  31.67 
 
 
323 aa  123  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  29.53 
 
 
328 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0250  hypothetical protein  30.67 
 
 
319 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  32 
 
 
330 aa  122  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  32.82 
 
 
330 aa  122  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5359  extra-cytoplasmic solute receptor  29.76 
 
 
323 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00868603  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4195  hypothetical protein  33.73 
 
 
331 aa  122  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  32.94 
 
 
314 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  28.48 
 
 
331 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  29.37 
 
 
326 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5403  hypothetical protein  26.44 
 
 
340 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.848586 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  28.3 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  32.65 
 
 
332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  32.17 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  29.64 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0712  hypothetical protein  32.27 
 
 
324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.780507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  30.34 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  30.08 
 
 
339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  29.14 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  31.32 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  31.4 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  27.48 
 
 
330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3371  twin-arginine translocation pathway signal  36 
 
 
341 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  29.43 
 
 
326 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  29.58 
 
 
328 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  31.64 
 
 
322 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6179  hypothetical protein  30.66 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  31.95 
 
 
322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  29.41 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  32.94 
 
 
322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  30 
 
 
322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0210  hypothetical protein  31.37 
 
 
322 aa  120  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  34.21 
 
 
332 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4804  hypothetical protein  32.93 
 
 
350 aa  119  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.589881  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  29.64 
 
 
320 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  30.06 
 
 
328 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  31.39 
 
 
318 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  30.68 
 
 
328 aa  119  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2041  hypothetical protein  32.23 
 
 
320 aa  119  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  32.43 
 
 
338 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  28.96 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  32.84 
 
 
358 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  32.17 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2399  hypothetical protein  30.23 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  31.64 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  28.52 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>