More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1887 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 162 aa  327  3e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  67.48 
 
 		 167 aa  230  7.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  66.06 
 
 		 166 aa  213  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  64.56 
 
 		 166 aa  208  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  62.35 
 
 		 166 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  61.82 
 
 		 167 aa  202  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  61.39 
 
 		 160 aa  202  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  59.88 
 
 		 164 aa  197  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  61.21 
 
 		 164 aa  195  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  58.13 
 
 		 164 aa  191  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  58.6 
 
 		 172 aa  185  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  59.87 
 
 		 160 aa  184  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 		 160 aa  181  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  56.79 
 
 		 163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  59.12 
 
 		 163 aa  181  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  58.9 
 
 		 160 aa  180  9.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  58.28 
 
 		 161 aa  179  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  56.69 
 
 		 160 aa  178  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  59.88 
 
 		 162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  56.17 
 
 		 167 aa  177  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  57.23 
 
 		 165 aa  176  9e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  55.42 
 
 		 164 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  55.69 
 
 		 164 aa  173  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  54.82 
 
 		 164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  54.55 
 
 		 164 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  54.55 
 
 		 164 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  54.55 
 
 		 164 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  57.05 
 
 		 161 aa  168  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  54.27 
 
 		 164 aa  168  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  54.66 
 
 		 164 aa  167  6e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  55.15 
 
 		 164 aa  166  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  53.8 
 
 		 165 aa  158  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  53.8 
 
 		 165 aa  154  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  52.47 
 
 		 167 aa  154  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  51.3 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  50.97 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  47.83 
 
 		 159 aa  133  9e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  48.39 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  42.86 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  42.86 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  42.86 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1945  GreA/GreB family elongation factor  52.58 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  38.61 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  42.48 
 
 		 155 aa  97.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4781  GreA/GreB family elongation factor  50.52 
 
 		 159 aa  97.1  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  41.25 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  39.29 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  41.5 
 
 		 155 aa  94  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  40.56 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  39.29 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  36.94 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  41.1 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  40.14 
 
 		 159 aa  90.5  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  39.24 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  37.34 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  39.86 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  36.17 
 
 		 156 aa  88.6  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  37.66 
 
 		 161 aa  88.2  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  42.65 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 156 aa  87.4  8e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  40.27 
 
 		 154 aa  87  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1310  transcription elongation factor GreA  36.13 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.324095  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  38.67 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  38.67 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  36.02 
 
 		 160 aa  85.1  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  35.92 
 
 		 159 aa  84.7  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  37.89 
 
 		 157 aa  84.3  6e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  37.09 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  37.33 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  40.85 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  37.09 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  34.23 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  37.59 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  35.48 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  37.42 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0951  GreA/GreB family elongation factor  36.84 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000196364  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  32.87 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  37.24 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  36.18 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  35.81 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  35.1 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  38.85 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0158  transcription elongation factor GreA  33.11 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  37.24 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3810  transcription elongation factor GreB  33.81 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2847  transcription elongation factor GreA  36.18 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000241028  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3704  transcription elongation factor GreB  33.81 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3701  transcription elongation factor GreB  33.81 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3776  transcription elongation factor GreB  33.81 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4016  transcription elongation factor GreB  33.12 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3890  transcription elongation factor GreB  34.51 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  35.62 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>