225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1674 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  100 
 
 
325 aa  652    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  42.63 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  40.13 
 
 
308 aa  190  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  40.6 
 
 
327 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  38.36 
 
 
301 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  38.23 
 
 
307 aa  165  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  36.3 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  39.39 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  35.27 
 
 
299 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  38.49 
 
 
293 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  37.09 
 
 
306 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  38.7 
 
 
290 aa  158  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  33.88 
 
 
297 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  31.56 
 
 
314 aa  157  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  35.31 
 
 
318 aa  157  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  34.87 
 
 
301 aa  152  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  33.77 
 
 
315 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  33.79 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  34.1 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  34.52 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  32.12 
 
 
295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  32.12 
 
 
295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  32.12 
 
 
295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  32.36 
 
 
308 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  32.36 
 
 
308 aa  135  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  32.36 
 
 
308 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  33.76 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  34.12 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  32.9 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  33.55 
 
 
303 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  33.11 
 
 
300 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  33.22 
 
 
300 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  36.74 
 
 
307 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  32.06 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  32.68 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  33.77 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  34.54 
 
 
290 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  32.14 
 
 
323 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  34.36 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  31.83 
 
 
318 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  33.11 
 
 
323 aa  120  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  32.18 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  31.83 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  31.25 
 
 
318 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  26.49 
 
 
262 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  32.08 
 
 
329 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  27.99 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  28.31 
 
 
316 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  30.15 
 
 
312 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  27.97 
 
 
269 aa  94  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  32.52 
 
 
282 aa  90.5  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  28.57 
 
 
263 aa  89.4  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  31.73 
 
 
328 aa  87.8  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  31.36 
 
 
345 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  30.17 
 
 
334 aa  86.7  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  26.22 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  28.1 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  28.62 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  24.91 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  29.1 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4225  aldose 1-epimerase  27.67 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387725  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  30.29 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  28.67 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  26.88 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  29.62 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  25.83 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  28.36 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  23.23 
 
 
290 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  23.23 
 
 
290 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  32.62 
 
 
296 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  22.82 
 
 
290 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6635  Aldose 1-epimerase  33.33 
 
 
361 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.779767  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  23.23 
 
 
290 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  29.39 
 
 
295 aa  63.5  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  23.23 
 
 
290 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  23.23 
 
 
290 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  34.86 
 
 
353 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0803  aldose 1-epimerase  27.72 
 
 
289 aa  62.4  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  37.19 
 
 
323 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  34.86 
 
 
297 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  27.24 
 
 
298 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  22.48 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  31.48 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  31.43 
 
 
353 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  31.55 
 
 
346 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  31.43 
 
 
353 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  28.86 
 
 
294 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  29.48 
 
 
300 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  29.48 
 
 
300 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  29.48 
 
 
300 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  24.5 
 
 
290 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  30.22 
 
 
353 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  22.61 
 
 
305 aa  60.1  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1048  aldose 1-epimerase  24.4 
 
 
297 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  31.31 
 
 
346 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  33.17 
 
 
414 aa  59.3  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  29.29 
 
 
353 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  34.55 
 
 
353 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  30.86 
 
 
402 aa  58.9  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2624  aldose 1-epimerase  31.33 
 
 
371 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>