More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3536 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
336 aa  671    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  76.58 
 
 
336 aa  525  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  76.51 
 
 
336 aa  524  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  73.65 
 
 
336 aa  512  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  71.52 
 
 
330 aa  490  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  48.31 
 
 
322 aa  309  5e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  47.99 
 
 
328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  47.99 
 
 
328 aa  299  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  49.38 
 
 
326 aa  296  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  45.87 
 
 
328 aa  296  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  45.05 
 
 
328 aa  288  8e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  44.58 
 
 
336 aa  285  5e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  46.75 
 
 
332 aa  286  5e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  45.14 
 
 
328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  43.03 
 
 
327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  45.79 
 
 
328 aa  278  9e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  41.32 
 
 
327 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  41.32 
 
 
327 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  43.69 
 
 
335 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  43.38 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  42.28 
 
 
329 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  42.28 
 
 
329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  39.09 
 
 
327 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  40.56 
 
 
321 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  38.7 
 
 
325 aa  228  9e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  34.76 
 
 
333 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  43.58 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  33 
 
 
348 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  32.85 
 
 
391 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  31.35 
 
 
335 aa  144  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  29.63 
 
 
332 aa  143  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  34.43 
 
 
324 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  40 
 
 
366 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  38.64 
 
 
322 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  36.26 
 
 
352 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  36.7 
 
 
369 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  32.7 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  40.41 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  40.34 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  39.77 
 
 
325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  31.33 
 
 
338 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  38.64 
 
 
388 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  37.17 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  37.17 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  37.7 
 
 
320 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  36.49 
 
 
388 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  28.23 
 
 
370 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  31.94 
 
 
335 aa  123  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  37.5 
 
 
390 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  37.21 
 
 
405 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  35.32 
 
 
419 aa  122  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  35.68 
 
 
369 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  31.62 
 
 
360 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  31.37 
 
 
323 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  31.37 
 
 
323 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  32.54 
 
 
428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  26.97 
 
 
363 aa  119  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  36.36 
 
 
430 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  35.23 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  39.23 
 
 
427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  29.66 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  37.5 
 
 
425 aa  114  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  38.6 
 
 
345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  32.41 
 
 
419 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  31.47 
 
 
239 aa  112  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  35.53 
 
 
468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  33.19 
 
 
477 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  37.36 
 
 
426 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  36.47 
 
 
355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  33.52 
 
 
424 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  33.19 
 
 
401 aa  109  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  32.27 
 
 
493 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38040  predicted protein  39.31 
 
 
437 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.990763  hitchhiker  0.00560331 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  35.2 
 
 
451 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  31.12 
 
 
459 aa  106  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  38.54 
 
 
623 aa  105  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1798  ATP-dependent M41 family peptidase  34.16 
 
 
1284 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  34.78 
 
 
624 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0353  peptidase M41, FtsH  36.41 
 
 
575 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.209104  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10341  cell division protein FtsH4  36.41 
 
 
575 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194795  hitchhiker  0.000108584 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  36.06 
 
 
644 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  37.04 
 
 
425 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.65 
 
 
655 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  40.25 
 
 
784 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.66 
 
 
781 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.34 
 
 
662 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  38.46 
 
 
616 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  34.91 
 
 
649 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  34.65 
 
 
625 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.91 
 
 
651 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  35.29 
 
 
660 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  35.78 
 
 
651 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  37.17 
 
 
650 aa  100  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  35.1 
 
 
644 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  35.29 
 
 
658 aa  100  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  35.1 
 
 
647 aa  100  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  35.1 
 
 
644 aa  100  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  35.1 
 
 
644 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  35.1 
 
 
644 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.91 
 
 
654 aa  100  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>