More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0171 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0171  RNA-binding S4 domain-containing protein  100 
 
 		 200 aa  407  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.295675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  64.18 
 
 		 201 aa  270  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  62.38 
 
 		 202 aa  269  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  64.68 
 
 		 201 aa  269  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5761  ribosomal protein S4  62.69 
 
 		 201 aa  269  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  61.19 
 
 		 201 aa  267  8.999999999999999e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  60.4 
 
 		 201 aa  253  1.0000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  60.89 
 
 		 201 aa  252  2.0000000000000002e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  61.88 
 
 		 201 aa  251  6e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  61.19 
 
 		 200 aa  249  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1641  ribosomal protein S4  59.9 
 
 		 201 aa  242  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1391  RNA-binding S4 domain-containing protein  54.95 
 
 		 201 aa  218  3.9999999999999997e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  50.96 
 
 		 208 aa  202  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0437  ribosomal protein S4  50.74 
 
 		 203 aa  196  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000069036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0517  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 208 aa  196  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  46.63 
 
 		 208 aa  196  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0456  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.189833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 208 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 208 aa  194  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  49.5 
 
 		 203 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0743  ribosomal protein S4  51.94 
 
 		 206 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.068041  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 208 aa  193  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04497  30S ribosomal protein S4  51.44 
 
 		 208 aa  193  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.777393  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2348  30S ribosomal protein S4  48.06 
 
 		 206 aa  192  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06490  30S ribosomal protein S4  49.03 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0346  ribosomal protein S4  48.79 
 
 		 207 aa  192  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0861  30S ribosomal protein S4  48.06 
 
 		 206 aa  191  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  49.03 
 
 		 206 aa  191  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0779  30S ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 209 aa  191  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09100  30S ribosomal protein S4  48.54 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.908313 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0223  30S ribosomal protein S4  49.03 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00230473  unclonable  0.0000000000516884 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0255  30S ribosomal protein S4  48.54 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  49.03 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4666  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  unclonable  0.00000000965042 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2300  30S ribosomal protein S4  49.03 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1497  ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 208 aa  189  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0223  30S ribosomal protein S4  48.54 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000007109  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0218  30S ribosomal protein S4  48.54 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000114073  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  49.03 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4295  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000502229  hitchhiker  0.00000000110473 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3503  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2607  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1949  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3144  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3751  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3721  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.471129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0652  30S ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 208 aa  188  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000063481 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3885  30S ribosomal protein S4  47.57 
 
 		 206 aa  188  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0632608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3735  30S ribosomal protein S4  48.54 
 
 		 206 aa  188  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000110035  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 208 aa  188  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3779  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 207 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4146  30S ribosomal protein S4  48.54 
 
 		 206 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0220  30S ribosomal protein S4  48.54 
 
 		 206 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000964484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4032  30S ribosomal protein S4  48.54 
 
 		 206 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000124947  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0223  30S ribosomal protein S4  48.54 
 
 		 206 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0208  30S ribosomal protein S4  48.54 
 
 		 206 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000624869  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0194  30S ribosomal protein S4  48.54 
 
 		 206 aa  187  7e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127646  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 208 aa  187  8e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0650  ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 206 aa  187  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.955539  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4525  30S ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 206 aa  187  9e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815516  normal  0.577839 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 208 aa  187  9e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  49.03 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0352  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2734  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  48.06 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0373  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.762852  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2150  30S ribosomal protein S4  49.03 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000017924  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5056  30S ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00247728  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3472  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  46.8 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0301  30S ribosomal protein S4  48.79 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152221  normal  0.0772792 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0172  30S ribosomal protein S4  48.06 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000508668  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  47.8 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3043  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 207 aa  185  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  46.57 
 
 		 203 aa  186  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2814  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0136866  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001718  SSU ribosomal protein S4p (S9e)  48.54 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000581298  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00753  30S ribosomal protein S4  48.54 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4725  30S ribosomal protein S4  48.06 
 
 		 206 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766159  normal  0.270309 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0292  30S ribosomal protein S4  48.79 
 
 		 213 aa  184  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0274  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 207 aa  184  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0146675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0507  30S ribosomal protein S4  47.57 
 
 		 206 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0166592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 208 aa  184  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2145  ribosomal protein S4  46.12 
 
 		 206 aa  184  7e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.592371 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  47.57 
 
 		 206 aa  184  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0478  30S ribosomal protein S4  47.57 
 
 		 206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269214 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  46.8 
 
 		 203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  45.85 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0318  ribosomal protein S4  48.79 
 
 		 206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.665336  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0983  SSU ribosomal protein S4P  47.57 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923822  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  47.12 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0511  30S ribosomal protein S4  47.57 
 
 		 206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595592  normal  0.0197267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0343  30S ribosomal protein S4  48.06 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0236416  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2925  30S ribosomal protein S4  48.31 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>