More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1667 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 
267 aa  527  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  43.13 
 
 
262 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  49.04 
 
 
265 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  47.47 
 
 
272 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  47.73 
 
 
266 aa  236  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  49.58 
 
 
302 aa  231  7.000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  46.21 
 
 
267 aa  229  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  46.79 
 
 
267 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  46.79 
 
 
267 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  43.9 
 
 
256 aa  225  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  40.75 
 
 
279 aa  224  9e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  44.57 
 
 
266 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  44.13 
 
 
275 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  43.63 
 
 
267 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  45.34 
 
 
274 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 
280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  42.51 
 
 
280 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  46.12 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  44.02 
 
 
257 aa  219  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  42.08 
 
 
256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  53.69 
 
 
270 aa  219  5e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  47.37 
 
 
267 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  45.38 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  46.37 
 
 
265 aa  215  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  44.49 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  46.38 
 
 
271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  45 
 
 
268 aa  213  3.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  47.01 
 
 
278 aa  212  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  44.13 
 
 
266 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  44.13 
 
 
271 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  38.13 
 
 
258 aa  210  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  47.54 
 
 
263 aa  209  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  45.49 
 
 
265 aa  209  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  44.27 
 
 
271 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  43.02 
 
 
271 aa  208  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  47.46 
 
 
260 aa  208  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  44.75 
 
 
269 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2138  tryptophan synthase subunit alpha  44.3 
 
 
263 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  45.77 
 
 
290 aa  207  2e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  43.63 
 
 
263 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  43.63 
 
 
259 aa  206  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  43.53 
 
 
268 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  40.54 
 
 
257 aa  204  9e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1185  tryptophan synthase, alpha subunit  47.89 
 
 
267 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00172865  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  44.79 
 
 
269 aa  203  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  45.77 
 
 
269 aa  202  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  37.64 
 
 
279 aa  202  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  40.68 
 
 
269 aa  202  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  44.17 
 
 
261 aa  202  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  44.3 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  43.13 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  47.52 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  42.26 
 
 
264 aa  198  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  43.51 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  42.08 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  45.8 
 
 
285 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  42.86 
 
 
269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  41.51 
 
 
267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  45.42 
 
 
285 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  45.42 
 
 
285 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  41.85 
 
 
269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  41.73 
 
 
279 aa  195  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  41.87 
 
 
254 aa  195  6e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  42.59 
 
 
269 aa  195  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  42.96 
 
 
278 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 
267 aa  195  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  42.8 
 
 
269 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  44.62 
 
 
278 aa  194  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  45.31 
 
 
273 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  42.08 
 
 
277 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  45.78 
 
 
261 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  41.11 
 
 
274 aa  192  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  41.98 
 
 
269 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  44.59 
 
 
278 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  42.23 
 
 
279 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1172  tryptophan synthase, alpha chain  39.38 
 
 
258 aa  191  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  38.64 
 
 
265 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  41.34 
 
 
279 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  40.93 
 
 
279 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 
258 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  43.5 
 
 
278 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  40.93 
 
 
279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  41.98 
 
 
261 aa  189  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  41.34 
 
 
279 aa  189  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  47.71 
 
 
302 aa  189  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  40.74 
 
 
270 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  41.15 
 
 
269 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  38.26 
 
 
265 aa  188  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 
281 aa  188  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  40.55 
 
 
266 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2089  tryptophan synthase, alpha chain  45.42 
 
 
263 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  44.3 
 
 
272 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  40.65 
 
 
274 aa  187  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  43.93 
 
 
278 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  42.98 
 
 
279 aa  186  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  38.46 
 
 
255 aa  186  4e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  39.42 
 
 
258 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  39.42 
 
 
258 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4047  tryptophan synthase subunit alpha  37.07 
 
 
258 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  38.46 
 
 
255 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>