More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0336 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0336  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 242 aa  495  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3106  transcriptional regulator, GntR family  47.42 
 
 		 215 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3521  GntR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 227 aa  184  9e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3609  transcriptional regulator, GntR family  44.88 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7518  transcriptional regulator  43.07 
 
 		 227 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19990  transcriptional regulator, GntR family  39.05 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 235 aa  101  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 235 aa  101  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 		 232 aa  95.9  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 229 aa  95.1  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 231 aa  92.8  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 290 aa  92  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 246 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.07 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.41 
 
 		 223 aa  89.4  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  35.63 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 223 aa  85.5  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 234 aa  85.1  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4700  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.445509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  36.05 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  28.29 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  28 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  28.07 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  35.42 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  30.22 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  30.73 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>