162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3421 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0454  hypothetical protein  34.52 
 
 		 1147 aa  648    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141895  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1885  ImcF-like family protein  34.95 
 
 		 1164 aa  691    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0217268  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  99.83 
 
 		 1164 aa  2406    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  100 
 
 		 1164 aa  2410    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1026  hypothetical protein  34.52 
 
 		 1167 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170738  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0805  hypothetical protein  34.52 
 
 		 1167 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00300591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0717  hypothetical protein  34.52 
 
 		 1167 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.319931  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2000  hypothetical protein  34.52 
 
 		 1167 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2090  hypothetical protein  33.97 
 
 		 1104 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127209  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0730  hypothetical protein  36.44 
 
 		 728 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000967191  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  27.71 
 
 		 1199 aa  452  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  27.15 
 
 		 1220 aa  399  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1208 aa  395  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  27.36 
 
 		 1209 aa  391  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  25.27 
 
 		 1211 aa  388  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1205 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  27.77 
 
 		 1209 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  27.77 
 
 		 1209 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  27.77 
 
 		 1209 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  27.77 
 
 		 1209 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  26.35 
 
 		 1212 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  27.77 
 
 		 1209 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  25.21 
 
 		 1209 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  27.77 
 
 		 1209 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  27.77 
 
 		 1209 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1176 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  26.94 
 
 		 1218 aa  357  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  25.56 
 
 		 1171 aa  351  5e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  25.85 
 
 		 1207 aa  350  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1102 aa  344  5e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  25.61 
 
 		 1268 aa  310  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  24.57 
 
 		 1329 aa  307  9.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  24.11 
 
 		 1348 aa  299  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  24.42 
 
 		 1172 aa  291  6e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  24.15 
 
 		 1164 aa  284  7.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  25.37 
 
 		 1365 aa  266  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  24.93 
 
 		 1365 aa  262  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1275 aa  259  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  24.26 
 
 		 1275 aa  259  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  22.5 
 
 		 1182 aa  258  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  22.42 
 
 		 1181 aa  254  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  29.03 
 
 		 1302 aa  253  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  28.93 
 
 		 1302 aa  252  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  28.78 
 
 		 1302 aa  250  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1369 aa  249  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  28.19 
 
 		 1302 aa  247  8e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  24.66 
 
 		 1366 aa  241  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  27.45 
 
 		 1302 aa  237  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1192 aa  235  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  28.37 
 
 		 1358 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  28.37 
 
 		 1358 aa  233  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  28.37 
 
 		 1358 aa  233  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  27.55 
 
 		 1302 aa  231  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  23.53 
 
 		 1204 aa  229  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  28.5 
 
 		 1317 aa  226  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  27.47 
 
 		 1289 aa  222  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  27.32 
 
 		 1289 aa  220  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  27.32 
 
 		 1289 aa  220  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  27.16 
 
 		 1289 aa  219  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  22.54 
 
 		 1152 aa  218  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1332 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  23.68 
 
 		 1179 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  22.1 
 
 		 1148 aa  211  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  21.1 
 
 		 1187 aa  212  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  23.93 
 
 		 1150 aa  212  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  22.04 
 
 		 1182 aa  210  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  22.72 
 
 		 1168 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1175 aa  210  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  22.27 
 
 		 1165 aa  207  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1179 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  22.01 
 
 		 1165 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1208 aa  198  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  22.55 
 
 		 1165 aa  197  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  21.77 
 
 		 1177 aa  190  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  21.77 
 
 		 1177 aa  190  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  21.51 
 
 		 1194 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1181 aa  175  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0731  hypothetical protein  31.43 
 
 		 443 aa  168  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00636077  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  21.71 
 
 		 1205 aa  167  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  23.33 
 
 		 1175 aa  167  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0929  SciS protein  29.27 
 
 		 431 aa  165  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1216  hypothetical protein  29.27 
 
 		 431 aa  165  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  24.96 
 
 		 1176 aa  151  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  21.64 
 
 		 1230 aa  150  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  27.86 
 
 		 1157 aa  148  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  22.19 
 
 		 1173 aa  141  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  22.06 
 
 		 1173 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1206 aa  131  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  22.87 
 
 		 1206 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  22.06 
 
 		 1174 aa  127  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1174 aa  126  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  22.41 
 
 		 1175 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05857  hypothetical protein  21.06 
 
 		 1129 aa  124  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1099  type VI secretion protein IcmF  21.51 
 
 		 1153 aa  116  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1218  hypothetical protein  21.51 
 
 		 1153 aa  115  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  27.2 
 
 		 830 aa  114  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0524  hypothetical protein  21.2 
 
 		 973 aa  112  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0500  hypothetical protein  21.2 
 
 		 973 aa  112  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  25 
 
 		 831 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  24.66 
 
 		 831 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>