More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2413 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1306  glycogen debranching enzyme GlgX  53.53 
 
 		 720 aa  660    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.348446 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1726  glycogen debranching enzyme GlgX  56.75 
 
 		 748 aa  778    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1345  glycogen debranching enzyme GlgX  59.38 
 
 		 756 aa  758    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1101  glycogen debranching enzyme GlgX  59.75 
 
 		 738 aa  771    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.429589  hitchhiker  0.00127607 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10400  glycogen debranching enzyme GlgX  61.14 
 
 		 822 aa  732    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2413  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 771 aa  1545    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246896  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  45.83 
 
 		 707 aa  566  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  44.54 
 
 		 723 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  44.27 
 
 		 710 aa  559  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  48.52 
 
 		 700 aa  562  1e-158  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  43.77 
 
 		 721 aa  558  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1695  pullulanase-like glycosidase  43.83 
 
 		 846 aa  556  1e-157  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.195322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  44.87 
 
 		 712 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  44.87 
 
 		 712 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  44.63 
 
 		 729 aa  551  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  42.51 
 
 		 704 aa  551  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  44.27 
 
 		 701 aa  552  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  43.65 
 
 		 755 aa  549  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  44.48 
 
 		 720 aa  548  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  45.5 
 
 		 712 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19030  glycogen debranching enzyme GlgX  48.53 
 
 		 747 aa  548  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  44.62 
 
 		 719 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  43.13 
 
 		 738 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  43.27 
 
 		 738 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  42.61 
 
 		 721 aa  547  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  42.13 
 
 		 726 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  44.17 
 
 		 720 aa  545  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  43.02 
 
 		 688 aa  542  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  40.85 
 
 		 710 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  43.47 
 
 		 758 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  43.47 
 
 		 758 aa  543  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0543  glycogen debranching enzyme GlgX  46.71 
 
 		 704 aa  545  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0247855  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  44.26 
 
 		 779 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  46.95 
 
 		 701 aa  541  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  43.56 
 
 		 722 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  44.23 
 
 		 719 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  42.66 
 
 		 733 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  42.36 
 
 		 727 aa  536  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  43.26 
 
 		 752 aa  537  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  44.28 
 
 		 733 aa  538  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  41.67 
 
 		 717 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  41.23 
 
 		 719 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0857  glycogen debranching enzyme GlgX  47.56 
 
 		 703 aa  533  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6085  glycogen debranching enzyme GlgX  46.63 
 
 		 705 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  43.07 
 
 		 728 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1333  glycogen debranching protein GlgX  46.63 
 
 		 705 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0242466  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  44.65 
 
 		 701 aa  533  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  42.56 
 
 		 716 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  42.9 
 
 		 751 aa  534  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6496  glycogen debranching enzyme GlgX  46.63 
 
 		 705 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0828061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  42.11 
 
 		 756 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  45.24 
 
 		 709 aa  535  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  41.15 
 
 		 717 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  43.63 
 
 		 712 aa  531  1e-149  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  44.71 
 
 		 754 aa  531  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  43.6 
 
 		 720 aa  530  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  42.88 
 
 		 718 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6824  glycogen debranching enzyme GlgX  45.47 
 
 		 739 aa  532  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  41.66 
 
 		 706 aa  529  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  46.05 
 
 		 708 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  42.23 
 
 		 716 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  44.11 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  41.21 
 
 		 717 aa  532  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  41.91 
 
 		 717 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  42.24 
 
 		 720 aa  528  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  40.88 
 
 		 727 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  41.67 
 
 		 720 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  42.7 
 
 		 710 aa  528  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3665  glycogen debranching protein GlgX  44.07 
 
 		 830 aa  528  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1070  glycogen debranching enzyme GlgX  43.39 
 
 		 802 aa  528  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  42.88 
 
 		 745 aa  528  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  41.4 
 
 		 708 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  42.94 
 
 		 704 aa  526  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  43.88 
 
 		 1464 aa  528  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  42.27 
 
 		 723 aa  528  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  42.9 
 
 		 1537 aa  522  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  44.32 
 
 		 706 aa  522  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  42.27 
 
 		 701 aa  523  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2864  putative glycogen operon protein GlgX  45.18 
 
 		 739 aa  525  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  42.7 
 
 		 721 aa  524  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  41.99 
 
 		 752 aa  525  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2933  glycogen debranching enzyme GlgX  41.66 
 
 		 752 aa  524  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  43.49 
 
 		 712 aa  523  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  41.98 
 
 		 757 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  43.18 
 
 		 721 aa  525  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  38.49 
 
 		 718 aa  521  1e-146  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1495  glycogen operon protein  41.57 
 
 		 750 aa  519  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  41.28 
 
 		 727 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  44.05 
 
 		 720 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  43.34 
 
 		 779 aa  521  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  42.61 
 
 		 716 aa  522  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  44.19 
 
 		 722 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  41.79 
 
 		 752 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0733  glycogen debranching enzyme GlgX  52.44 
 
 		 704 aa  521  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  45.35 
 
 		 718 aa  520  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  43.34 
 
 		 701 aa  519  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  44.05 
 
 		 720 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  41.2 
 
 		 709 aa  522  1e-146  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  41.03 
 
 		 711 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4049  glycogen debranching enzyme GlgX  44.43 
 
 		 766 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.928409  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>