More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2325 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  49.6 
 
 		 752 aa  648    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  100 
 
 		 759 aa  1525    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  46.07 
 
 		 737 aa  593  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  45.24 
 
 		 717 aa  536  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5423  UvrD/REP helicase  38.86 
 
 		 821 aa  462  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106532  normal  0.207547 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  35.14 
 
 		 699 aa  330  7e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  35.52 
 
 		 696 aa  326  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.47 
 
 		 737 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  34.44 
 
 		 714 aa  315  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  32.93 
 
 		 705 aa  303  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  32.12 
 
 		 703 aa  293  6e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  32.12 
 
 		 703 aa  293  6e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  33.79 
 
 		 708 aa  273  9e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  30.05 
 
 		 712 aa  265  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  31.48 
 
 		 706 aa  264  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  29.67 
 
 		 716 aa  249  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  30.3 
 
 		 690 aa  249  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0110  putative DNA helicase  33.08 
 
 		 659 aa  247  6.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  29.17 
 
 		 704 aa  243  7e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  29.17 
 
 		 704 aa  243  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.23 
 
 		 704 aa  243  9e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  30 
 
 		 696 aa  235  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  28.05 
 
 		 705 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  30.29 
 
 		 711 aa  219  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  31.68 
 
 		 685 aa  217  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  34.72 
 
 		 603 aa  216  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  31.2 
 
 		 687 aa  207  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  29.14 
 
 		 662 aa  207  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  28.11 
 
 		 673 aa  204  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1320  superfamily I DNA/RNA helicase  27.98 
 
 		 683 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.875169  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  33.53 
 
 		 679 aa  194  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  31.72 
 
 		 734 aa  162  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  31.29 
 
 		 809 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  31.12 
 
 		 700 aa  147  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  28.54 
 
 		 710 aa  141  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  24.18 
 
 		 819 aa  135  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  29.27 
 
 		 712 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  27.92 
 
 		 697 aa  131  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  27.63 
 
 		 695 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  24.9 
 
 		 815 aa  123  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  25.79 
 
 		 1107 aa  120  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  26.03 
 
 		 695 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  27.98 
 
 		 663 aa  110  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  23.09 
 
 		 564 aa  95.1  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  29.67 
 
 		 593 aa  85.9  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  30.98 
 
 		 615 aa  79  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  23.35 
 
 		 671 aa  75.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  30.04 
 
 		 601 aa  75.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  29.96 
 
 		 612 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  25.21 
 
 		 508 aa  71.6  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  29.27 
 
 		 610 aa  68.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  22.06 
 
 		 1016 aa  68.6  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  21.81 
 
 		 699 aa  68.6  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3362  UvrD family helicase  24.6 
 
 		 630 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.753608  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  25.99 
 
 		 712 aa  67.8  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  29.17 
 
 		 632 aa  67.8  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  31.1 
 
 		 619 aa  66.6  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  29.84 
 
 		 625 aa  66.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  28.28 
 
 		 717 aa  65.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  30.38 
 
 		 619 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  29.2 
 
 		 607 aa  63.9  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4241  UvrD/REP helicase  24.41 
 
 		 907 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000158675 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  25.45 
 
 		 721 aa  63.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.75 
 
 		 781 aa  62.4  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.04 
 
 		 710 aa  62.4  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  28.57 
 
 		 588 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  28.1 
 
 		 701 aa  62  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  28.36 
 
 		 613 aa  61.6  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  24.62 
 
 		 689 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  25.8 
 
 		 717 aa  61.2  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.35 
 
 		 830 aa  61.2  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1463  UvrD/REP helicase  27.43 
 
 		 707 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0776  UvrD/REP helicase  28.49 
 
 		 1143 aa  60.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  47.22 
 
 		 845 aa  60.1  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.22 
 
 		 932 aa  59.7  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  24.81 
 
 		 691 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.51 
 
 		 786 aa  59.3  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  23.51 
 
 		 721 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  24.01 
 
 		 721 aa  58.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.52 
 
 		 833 aa  58.2  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.56 
 
 		 690 aa  58.5  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  24.75 
 
 		 726 aa  58.5  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47860  ATP-dependent DNA helicase Rep protein  41.43 
 
 		 669 aa  58.2  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1730  UvrD/REP helicase  26.85 
 
 		 916 aa  58.2  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0149  UvrD/REP helicase  35.45 
 
 		 695 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  24.7 
 
 		 706 aa  58.2  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  24.01 
 
 		 727 aa  58.2  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0137  UvrD/REP helicase  35.45 
 
 		 695 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  23.26 
 
 		 689 aa  57.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  25.19 
 
 		 691 aa  57.8  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  36.27 
 
 		 672 aa  57.8  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 1421 aa  57.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3329  UvrD/REP helicase  35.11 
 
 		 695 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544954  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1427  UvrD/REP helicase  27.65 
 
 		 707 aa  57.4  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.69 
 
 		 768 aa  57.4  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1409  UvrD/REP helicase  27.65 
 
 		 714 aa  57.4  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2668  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.9 
 
 		 629 aa  57.4  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111087  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  27.82 
 
 		 616 aa  57  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  23.26 
 
 		 689 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1824  UvrD/REP helicase  31.78 
 
 		 679 aa  57  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000550793  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>