76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0673 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  67.95 
 
 		 641 aa  869    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  67.06 
 
 		 598 aa  820    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  100 
 
 		 619 aa  1269    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  67 
 
 		 598 aa  821    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  49.67 
 
 		 600 aa  535  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  45.2 
 
 		 586 aa  521  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  39.77 
 
 		 615 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  40.3 
 
 		 606 aa  364  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.44 
 
 		 608 aa  331  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  27.01 
 
 		 604 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  27.57 
 
 		 610 aa  114  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  26.36 
 
 		 695 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.9 
 
 		 640 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.55 
 
 		 647 aa  74.7  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.06 
 
 		 594 aa  74.3  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  20 
 
 		 712 aa  66.2  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.57 
 
 		 603 aa  64.7  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.02 
 
 		 626 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.73 
 
 		 605 aa  62.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  22.16 
 
 		 645 aa  62.4  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4619  hypothetical protein  28.57 
 
 		 582 aa  60.8  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.275765 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  20.65 
 
 		 645 aa  60.5  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  26.13 
 
 		 626 aa  60.8  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.7 
 
 		 634 aa  60.5  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.46 
 
 		 607 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  21.95 
 
 		 685 aa  58.2  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.92 
 
 		 595 aa  57.4  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.56 
 
 		 613 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  23.79 
 
 		 564 aa  55.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  33.33 
 
 		 661 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  24.77 
 
 		 603 aa  55.1  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  21.97 
 
 		 674 aa  54.7  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  20.92 
 
 		 579 aa  54.3  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.07 
 
 		 550 aa  54.3  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  29.17 
 
 		 276 aa  53.9  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.33 
 
 		 616 aa  53.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  30.63 
 
 		 513 aa  52.8  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  41.79 
 
 		 688 aa  52.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  22.44 
 
 		 598 aa  51.6  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  31.53 
 
 		 628 aa  51.6  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  21.1 
 
 		 623 aa  50.4  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.62 
 
 		 608 aa  49.7  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  37.68 
 
 		 613 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  36.73 
 
 		 529 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  23.23 
 
 		 666 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  42.11 
 
 		 883 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  22.78 
 
 		 634 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3334  hypothetical protein  25.79 
 
 		 302 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1102  hypothetical protein  46.67 
 
 		 411 aa  48.9  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.89522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  43.75 
 
 		 875 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  21.11 
 
 		 707 aa  48.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1994  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.37 
 
 		 590 aa  47.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  19.8 
 
 		 703 aa  47.4  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  40.35 
 
 		 885 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  27.5 
 
 		 650 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.31 
 
 		 589 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  25.64 
 
 		 681 aa  47  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  24.21 
 
 		 505 aa  46.2  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.89 
 
 		 615 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  50 
 
 		 714 aa  46.2  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.04 
 
 		 573 aa  46.2  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  40.35 
 
 		 565 aa  45.8  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.76 
 
 		 652 aa  45.8  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  38.78 
 
 		 877 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  38.78 
 
 		 877 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  38.78 
 
 		 877 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  43.75 
 
 		 1051 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0003  recombination protein F  31.69 
 
 		 378 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  39.53 
 
 		 607 aa  44.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  43.75 
 
 		 478 aa  44.7  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  28.71 
 
 		 515 aa  44.3  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  24.75 
 
 		 682 aa  44.3  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.18 
 
 		 566 aa  43.9  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1132  hypothetical protein  50 
 
 		 358 aa  43.9  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0249333  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  23.19 
 
 		 398 aa  43.9  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  34 
 
 		 483 aa  43.5  0.01  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>