More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06906 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000904  hypothetical protein  79.63 
 
 		 216 aa  371  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  60.93 
 
 		 218 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  58.8 
 
 		 218 aa  280  9e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  59.07 
 
 		 218 aa  275  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  58.14 
 
 		 217 aa  270  9e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  57.21 
 
 		 218 aa  260  8.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3692  pentapeptide repeat-containing protein  57.67 
 
 		 218 aa  249  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.413415  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  52.91 
 
 		 223 aa  230  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  41.71 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  41.05 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  27.62 
 
 		 245 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  30.81 
 
 		 261 aa  88.6  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  25.37 
 
 		 381 aa  78.6  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  27.78 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  26.09 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  28.72 
 
 		 452 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 		 567 aa  74.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  26.56 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  29.29 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  30.06 
 
 		 453 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  30.64 
 
 		 485 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  27.78 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  30.22 
 
 		 264 aa  71.6  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  27.75 
 
 		 286 aa  71.6  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  29.49 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  23 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  24.87 
 
 		 489 aa  69.3  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  25.37 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  26.8 
 
 		 576 aa  69.3  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  25.13 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  25.85 
 
 		 872 aa  68.9  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  27.75 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  27.13 
 
 		 517 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  28.14 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  25 
 
 		 600 aa  66.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  25.13 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  24.68 
 
 		 521 aa  65.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 		 456 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  27.72 
 
 		 870 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  26.97 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  26.97 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  23.77 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  29.63 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  28.28 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  25.24 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  25.7 
 
 		 825 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  25.7 
 
 		 825 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  25.7 
 
 		 825 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  25.7 
 
 		 825 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  25.7 
 
 		 862 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  25.79 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  25.65 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  29.82 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  25.7 
 
 		 825 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  26.13 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  25.49 
 
 		 710 aa  62.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  26.98 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  25.7 
 
 		 825 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  26.04 
 
 		 343 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  25.45 
 
 		 734 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  27.91 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  26.04 
 
 		 343 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  27.31 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 401 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 		 515 aa  61.6  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  23.53 
 
 		 370 aa  61.6  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  23.4 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  25.71 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  22.07 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  34 
 
 		 180 aa  61.6  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  22.41 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  24.49 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  24.09 
 
 		 607 aa  61.2  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  25.65 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  25.82 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  25.23 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  24.49 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  25.74 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  23.33 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  25.84 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  25.26 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  24.42 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  31.69 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  25.7 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  22.63 
 
 		 493 aa  59.7  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  25.63 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  25.58 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  28.38 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  27.22 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  28.49 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  21.8 
 
 		 440 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  26.42 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  27.06 
 
 		 745 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  25.12 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  24.49 
 
 		 351 aa  58.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  24.04 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  24.39 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  23.74 
 
 		 844 aa  58.2  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>