More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002124 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  100 
 
 		 407 aa  838    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  83.54 
 
 		 407 aa  707    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  65.35 
 
 		 408 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  54.11 
 
 		 406 aa  458  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  45.05 
 
 		 404 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  44.25 
 
 		 404 aa  355  7.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  44.28 
 
 		 400 aa  346  4e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  36.54 
 
 		 408 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  37.56 
 
 		 406 aa  288  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  35.8 
 
 		 408 aa  288  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  36.36 
 
 		 409 aa  286  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  38.48 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  35.66 
 
 		 413 aa  273  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  35.43 
 
 		 406 aa  271  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  37.75 
 
 		 405 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  34.9 
 
 		 415 aa  253  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  33.92 
 
 		 413 aa  247  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  36.18 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  37.12 
 
 		 400 aa  238  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  33.92 
 
 		 411 aa  236  7e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  31.86 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  35.17 
 
 		 413 aa  225  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  32.84 
 
 		 412 aa  223  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  34.83 
 
 		 397 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  33.06 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  32.26 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  34.04 
 
 		 416 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  32.75 
 
 		 423 aa  210  5e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  32.52 
 
 		 411 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  31.5 
 
 		 411 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  31.68 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  32.98 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  30.27 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  31.05 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  32.09 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  31.78 
 
 		 411 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  30.39 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  31.7 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  32.44 
 
 		 403 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  32.45 
 
 		 414 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  32.27 
 
 		 424 aa  189  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  29.98 
 
 		 428 aa  186  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  29.38 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  30.49 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  30 
 
 		 423 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  29.53 
 
 		 400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  31.62 
 
 		 487 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  31.45 
 
 		 411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  28.64 
 
 		 419 aa  178  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  28.19 
 
 		 413 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  28.92 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  27.03 
 
 		 464 aa  173  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  28.82 
 
 		 411 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  28.57 
 
 		 417 aa  172  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  26.89 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  26.89 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  28.75 
 
 		 408 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  28.36 
 
 		 431 aa  167  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  29.27 
 
 		 410 aa  166  5e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  28.36 
 
 		 431 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  29.02 
 
 		 449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  29.51 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  25.56 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  31.44 
 
 		 448 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  29.08 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  27.51 
 
 		 412 aa  155  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  27.71 
 
 		 448 aa  155  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  27.01 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  29.43 
 
 		 447 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  25.44 
 
 		 419 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  30.1 
 
 		 444 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  28.53 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  26.78 
 
 		 414 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  25.65 
 
 		 460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  27.16 
 
 		 407 aa  126  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  25.46 
 
 		 458 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  22.82 
 
 		 403 aa  120  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  26.46 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  27.81 
 
 		 402 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  26.99 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  25.74 
 
 		 438 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  26.85 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  30.4 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  23.74 
 
 		 480 aa  99.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  27.2 
 
 		 418 aa  97.1  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  20.88 
 
 		 444 aa  92.8  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  22.63 
 
 		 463 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  23.24 
 
 		 439 aa  90.5  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  24.18 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  24.14 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  28.27 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  24.89 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2226  diguanylate phosphodiesterase  29.59 
 
 		 242 aa  75.5  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0863855  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2044  putative signal transduction protein  25.18 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  26.18 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0558  putative signal transduction protein  25.65 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  34.69 
 
 		 288 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0470  hypothetical protein  25.57 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129901  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  23.04 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  23.04 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>