76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1964 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  413  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  41.46 
 
 		 449 aa  141  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  64.84 
 
 		 482 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  64.84 
 
 		 452 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  44.24 
 
 		 430 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  54.37 
 
 		 455 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  43.95 
 
 		 410 aa  128  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  38.8 
 
 		 422 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  44.87 
 
 		 423 aa  125  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  34.09 
 
 		 442 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  40.94 
 
 		 437 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  35.93 
 
 		 410 aa  106  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  40.82 
 
 		 408 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  34.62 
 
 		 454 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  51.09 
 
 		 440 aa  103  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  52.75 
 
 		 439 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  44.68 
 
 		 406 aa  99.4  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  46.81 
 
 		 403 aa  98.2  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  36.43 
 
 		 422 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  37.82 
 
 		 421 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  47.62 
 
 		 427 aa  93.2  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  52.17 
 
 		 478 aa  92.4  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  48.35 
 
 		 420 aa  92.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  45.65 
 
 		 464 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  40 
 
 		 445 aa  86.3  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  40.18 
 
 		 769 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  44.44 
 
 		 709 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  48.05 
 
 		 577 aa  76.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  39.05 
 
 		 453 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  40.66 
 
 		 464 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  35 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  34.59 
 
 		 445 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  33.66 
 
 		 736 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  41.18 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  34.02 
 
 		 418 aa  65.1  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  46.55 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  35.4 
 
 		 369 aa  57  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  35.87 
 
 		 608 aa  55.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.65 
 
 		 429 aa  55.8  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  36.59 
 
 		 712 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  36.46 
 
 		 976 aa  53.9  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  33.72 
 
 		 369 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  36.59 
 
 		 532 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  32.32 
 
 		 228 aa  51.2  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  38.82 
 
 		 353 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  37.65 
 
 		 352 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  47.17 
 
 		 670 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  48.98 
 
 		 452 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  34.62 
 
 		 610 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  52.27 
 
 		 368 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  24.04 
 
 		 530 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  34.09 
 
 		 515 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  27.91 
 
 		 368 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  27.88 
 
 		 506 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  35.63 
 
 		 416 aa  47  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  36.05 
 
 		 619 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  35.09 
 
 		 176 aa  45.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  37.04 
 
 		 458 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  34.48 
 
 		 423 aa  44.7  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1783  hypothetical protein  25.6 
 
 		 447 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4110  ATPase-like protein  36.84 
 
 		 427 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000135453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  31.15 
 
 		 582 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  28.41 
 
 		 596 aa  42.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1135  hypothetical protein  32.39 
 
 		 447 aa  42.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.879789  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  37.5 
 
 		 457 aa  42.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1513  hypothetical protein  28.28 
 
 		 444 aa  42.4  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  31.17 
 
 		 378 aa  42  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  19.08 
 
 		 601 aa  42  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  29.33 
 
 		 533 aa  42  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1018  hypothetical protein  29.35 
 
 		 606 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88989e-33 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  32.47 
 
 		 540 aa  41.6  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  22.31 
 
 		 556 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  33.33 
 
 		 427 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  33.33 
 
 		 623 aa  41.2  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  37.29 
 
 		 708 aa  41.2  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>