More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0959 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  68.34 
 
 		 841 aa  1184    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  100 
 
 		 843 aa  1725    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  53.18 
 
 		 899 aa  847    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  71.19 
 
 		 842 aa  1281    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  97.75 
 
 		 843 aa  1659    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  41.69 
 
 		 850 aa  632  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  41.75 
 
 		 852 aa  632  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  41.64 
 
 		 852 aa  631  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  41.75 
 
 		 852 aa  632  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  41.18 
 
 		 852 aa  625  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  40 
 
 		 2638 aa  625  1e-177  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  40.86 
 
 		 848 aa  622  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  41.18 
 
 		 856 aa  610  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  41.64 
 
 		 852 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  40.62 
 
 		 848 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  41.64 
 
 		 852 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  50.32 
 
 		 640 aa  589  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  40.94 
 
 		 1043 aa  553  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  37.5 
 
 		 874 aa  532  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  43.61 
 
 		 647 aa  523  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  44.51 
 
 		 655 aa  524  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  43.47 
 
 		 1136 aa  524  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  44.04 
 
 		 655 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  43.59 
 
 		 713 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  42.92 
 
 		 713 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  42.92 
 
 		 713 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  42.99 
 
 		 713 aa  488  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  42.97 
 
 		 713 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  42.86 
 
 		 713 aa  489  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  42.64 
 
 		 713 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  42.39 
 
 		 713 aa  486  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  41.99 
 
 		 713 aa  482  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  39.49 
 
 		 712 aa  478  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  42.19 
 
 		 713 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  42.36 
 
 		 718 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  41.28 
 
 		 825 aa  462  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  35.85 
 
 		 1064 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  35.6 
 
 		 1064 aa  449  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  36.45 
 
 		 1888 aa  449  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  32.6 
 
 		 928 aa  414  1e-114  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  41.05 
 
 		 640 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  37.03 
 
 		 601 aa  382  1e-104  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.76 
 
 		 1117 aa  376  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  34.92 
 
 		 669 aa  350  7e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  34.82 
 
 		 766 aa  326  1e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  27.12 
 
 		 991 aa  298  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.43 
 
 		 1176 aa  295  3e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.65 
 
 		 1035 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  30.26 
 
 		 1432 aa  280  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  27.33 
 
 		 1062 aa  280  1e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  29.62 
 
 		 1429 aa  274  5.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  27.47 
 
 		 1942 aa  272  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.8 
 
 		 1855 aa  272  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  29.26 
 
 		 776 aa  269  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  29.28 
 
 		 1025 aa  267  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  29.02 
 
 		 1450 aa  266  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.07 
 
 		 2156 aa  260  9e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.51 
 
 		 946 aa  258  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.18 
 
 		 891 aa  256  9e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  27.03 
 
 		 1252 aa  252  2e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  29.7 
 
 		 1472 aa  249  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  27.54 
 
 		 998 aa  247  6.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.99 
 
 		 1331 aa  243  9e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  27.61 
 
 		 1329 aa  238  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  27.48 
 
 		 1328 aa  235  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.14 
 
 		 1248 aa  224  6e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.73 
 
 		 1891 aa  219  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.18 
 
 		 1975 aa  212  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.79 
 
 		 2068 aa  212  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.45 
 
 		 1124 aa  206  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  29.37 
 
 		 717 aa  202  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  31.29 
 
 		 1441 aa  201  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.74 
 
 		 1440 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.74 
 
 		 1440 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  28.19 
 
 		 706 aa  197  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  26.8 
 
 		 817 aa  196  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  27.98 
 
 		 671 aa  195  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  28.72 
 
 		 693 aa  191  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  27.68 
 
 		 708 aa  190  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  27.36 
 
 		 697 aa  185  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  27.52 
 
 		 696 aa  185  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  26 
 
 		 714 aa  185  4.0000000000000006e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  25.22 
 
 		 724 aa  182  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  25.6 
 
 		 694 aa  179  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  27.43 
 
 		 693 aa  177  9e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  26.92 
 
 		 721 aa  176  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  27.39 
 
 		 706 aa  176  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  27.56 
 
 		 718 aa  175  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  26.61 
 
 		 694 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  26.61 
 
 		 694 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0312  glycosyl hydrolase family protein  27.56 
 
 		 666 aa  173  1e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0426975  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  27.29 
 
 		 711 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  30.4 
 
 		 774 aa  172  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  26.96 
 
 		 711 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  28.1 
 
 		 695 aa  171  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  25.17 
 
 		 720 aa  171  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  27 
 
 		 708 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  25.78 
 
 		 729 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  25.04 
 
 		 693 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  27.14 
 
 		 701 aa  167  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>