More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2134 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 85 aa  167  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  75.76 
 
 		 79 aa  97.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  69.84 
 
 		 129 aa  94.4  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  62.32 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0645  transcriptional regulator, XRE family  60.38 
 
 		 74 aa  70.5  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000232876  normal  0.586198 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 76 aa  67  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  55 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2338  helix-turn-helix domain protein  53.97 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  44.93 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  44.93 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  47.54 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  48.33 
 
 		 70 aa  60.8  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 75 aa  60.1  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  41.18 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  47.54 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 74 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4534  helix-turn-helix domain protein  47.3 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  41.67 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  50.82 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2655  XRE family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  49.21 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2009  DNA-binding protein  42.03 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  48.15 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  35.48 
 
 		 87 aa  52.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  35.48 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2012  DNA-binding protein  48.08 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1080  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 81 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  40.85 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 390 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 73 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1992  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.979113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0791  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 214 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 73 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0107  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0687  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0236581  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 81 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2870  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  39.34 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5790  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.902407  hitchhiker  0.00485473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  35.62 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0172  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134297  normal  0.353283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 76 aa  50.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0695  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 101 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  38.24 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0668  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6198  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2521  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  45.9 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  46.55 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  41.94 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4174  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.852413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>