153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0005 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0005  restriction modification system DNA specificity domain protein  100 
 
 
378 aa  782  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0333  restriction modification system DNA specificity subunit  36.62 
 
 
371 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  45.61 
 
 
285 aa  203  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  35.28 
 
 
414 aa  192  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  35.54 
 
 
620 aa  164  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0500  restriction modification system DNA specificity subunit  33.02 
 
 
413 aa  155  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.565018  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2467  restriction modification system DNA specificity domain  33.43 
 
 
438 aa  152  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  37.26 
 
 
446 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3499  restriction modification system DNA specificity subunit  29.53 
 
 
405 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.082109 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2237  restriction modification system DNA specificity subunit  37.91 
 
 
412 aa  139  9e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1536  restriction modification system DNA specificity domain  30.72 
 
 
364 aa  136  6e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1544  restriction modification system DNA specificity domain protein  36.24 
 
 
374 aa  131  2e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  27.27 
 
 
397 aa  131  2e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1954  restriction modification system DNA specificity subunit  28.24 
 
 
406 aa  129  1e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2016  restriction modification system DNA specificity subunit  29.03 
 
 
417 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0839323  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6044  type I restriction-modification system subunit S  33.9 
 
 
547 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.061065  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01116  hypothetical protein  36.27 
 
 
400 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4241  restriction modification system DNA specificity subunit  28.65 
 
 
411 aa  122  1e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.491612  hitchhiker  0.00127278 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4348  restriction modification system DNA specificity subunit  30.06 
 
 
363 aa  119  8e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  27.11 
 
 
435 aa  119  1e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2621  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.2 
 
 
400 aa  115  2e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0836  type I restriction-modification system S subunit  28.3 
 
 
416 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12774  type I restriction/modification system specificity determinant hsdS  41.4 
 
 
364 aa  112  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1218  restriction modification system DNA specificity subunit  25.9 
 
 
351 aa  112  1e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.67755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.3 
 
 
429 aa  112  1e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2328  type I restriction-modification system specificity subunit  30.32 
 
 
404 aa  111  2e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2364  restriction modification system DNA specificity subunit  29.06 
 
 
413 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3571  hypothetical protein  28.78 
 
 
458 aa  110  4e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  27.86 
 
 
419 aa  110  4e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1327  restriction modification system DNA specificity subunit  27.78 
 
 
431 aa  109  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.280518 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4778  restriction modification system DNA specificity subunit  26.74 
 
 
415 aa  105  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16943  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3351  type I site-specific deoxyribonuclease S subunit  25.2 
 
 
354 aa  105  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00146581  normal  0.0102246 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3352  type I site-specific deoxyribonuclease S subunit  29.52 
 
 
303 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  5.13186e-05  normal  0.0100815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  26.54 
 
 
422 aa  103  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  34.91 
 
 
390 aa  100  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  2.69296e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.96 
 
 
428 aa  99.8  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0031  type I restriction-modification system specificity subunit  30.8 
 
 
411 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404176  normal  0.032892 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  25.91 
 
 
429 aa  98.6  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0023  type I restriction-modification system specificity subunit  30.8 
 
 
411 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834107  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0878  type I restriction modification system methylase  24.79 
 
 
424 aa  97.1  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  27.63 
 
 
416 aa  95.9  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0987  restriction modification system DNA specificity subunit  25.9 
 
 
390 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1087  type I restriction-modification system, S subunit  25.87 
 
 
422 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2791  type I restriction-modification system, S subunit  26.38 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  32.12 
 
 
400 aa  91.3  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2415  restriction modification system DNA specificity domain  26.38 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.589349  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  25.86 
 
 
432 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4472  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.59 
 
 
428 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  28.62 
 
 
430 aa  85.1  2e-15  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2910  putative type I restriction-modification system, S subunit  27.42 
 
 
373 aa  85.5  2e-15  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3144  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.3 
 
 
412 aa  84.7  2e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527027  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.13 
 
 
442 aa  84.7  3e-15  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0549  restriction modification system DNA specificity subunit  25.38 
 
 
385 aa  84.3  3e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2285  hypothetical protein  25.42 
 
 
425 aa  83.6  5e-15  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0313194  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  25.23 
 
 
549 aa  83.6  6e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0951  restriction modification system DNA specificity subunit  23 
 
 
419 aa  82.8  1e-14  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  4.06123e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  23.97 
 
 
420 aa  80.9  3e-14  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  22.65 
 
 
430 aa  79  1e-13  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3768  restriction modification system DNA specificity subunit  24.65 
 
 
374 aa  79  1e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36553  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  24.5 
 
 
447 aa  78.6  2e-13  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1360  restriction modification system DNA specificity subunit  25.21 
 
 
453 aa  76.6  6e-13  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  25.07 
 
 
471 aa  76.3  8e-13  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1941  restriction endonuclease S subunits-like  27.24 
 
 
451 aa  74.3  3e-12  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0182546  normal  0.0682578 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3382  restriction modification system DNA specificity subunit  24.44 
 
 
485 aa  73.9  4e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  35.38 
 
 
413 aa  73.9  5e-12  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3757  restriction modification system S subunit  25.6 
 
 
436 aa  72.4  1e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.386531  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0223  putative HsdS protein  26.32 
 
 
438 aa  69.3  9e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1219  restriction modification system DNA specificity domain  25.48 
 
 
412 aa  68.6  2e-10  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0808  specificity determinant HsdS-like  29.09 
 
 
363 aa  68.6  2e-10  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.361917  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1808  restriction modification system DNA specificity subunit  22.95 
 
 
483 aa  68.6  2e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300643  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1435  restriction modification system DNA specificity subunit  26.54 
 
 
340 aa  67.4  4e-10  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1037  restriction modification system DNA specificity domain  22.6 
 
 
364 aa  67.4  4e-10  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0890662  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1536  hypothetical protein  22.05 
 
 
380 aa  65.9  1e-09  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00344436  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0403  restriction modification system DNA specificity subunit  31.48 
 
 
402 aa  65.5  1e-09  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  24.44 
 
 
417 aa  64.7  2e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0006  restriction modification system, type I  23.51 
 
 
412 aa  65.1  2e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  21.67 
 
 
411 aa  64.3  3e-09  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4007  restriction endonuclease S subunits-like  23.38 
 
 
412 aa  64.7  3e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4455  restriction modification system DNA specificity subunit  28.12 
 
 
388 aa  62.4  1e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.353509  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2742  type I restriction-modification system specificity determinant  25 
 
 
398 aa  62  2e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971087  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0804  restriction modification system DNA specificity subunit  29.5 
 
 
368 aa  62  2e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526121  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2743  type I restriction-modification system, S subunit, truncation  30.95 
 
 
175 aa  61.2  3e-08  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.441032  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1452  restriction modification system DNA specificity domain  25 
 
 
392 aa  59.7  7e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0462219  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  22.89 
 
 
446 aa  59.3  1e-07  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  25.86 
 
 
397 aa  58.9  1e-07  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1890  type I restriction-modification system, S subunit  24.38 
 
 
416 aa  59.3  1e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4810  putative type I restriction-modification system specificity subunit  22.22 
 
 
360 aa  58.2  2e-07  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.7 
 
 
457 aa  58.5  2e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2093  restriction modification system DNA specificity subunit  23.81 
 
 
477 aa  58.9  2e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  21.58 
 
 
374 aa  58.5  2e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  22.06 
 
 
429 aa  57.4  4e-07  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1216  restriction modification system DNA specificity subunit  39.74 
 
 
427 aa  57  5e-07  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  23.2 
 
 
425 aa  57  5e-07  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  27.73 
 
 
456 aa  56.6  7e-07  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0369  N-6 DNA methylase  28.68 
 
 
764 aa  56.6  7e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3075  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.18 
 
 
388 aa  56.6  7e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40504  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  20.27 
 
 
425 aa  55.8  1e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2988  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.54 
 
 
386 aa  55.5  1e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2194  restriction modification system DNA specificity subunit  25.3 
 
 
427 aa  55.1  2e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.122675  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1122  restriction endonuclease S subunits-like  32.22 
 
 
428 aa  55.1  2e-06  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.878738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>