More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1039 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  41.7 
 
 		 1365 aa  932    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  47.12 
 
 		 1433 aa  1074    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  45.45 
 
 		 1436 aa  1039    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  45.18 
 
 		 1447 aa  1032    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  43.76 
 
 		 1468 aa  990    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  47.7 
 
 		 1433 aa  1084    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  47.62 
 
 		 1433 aa  1082    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  48.72 
 
 		 1435 aa  1141    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  41.96 
 
 		 1493 aa  917    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  47.7 
 
 		 1433 aa  1084    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  46.96 
 
 		 1440 aa  1115    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  47.14 
 
 		 1433 aa  1100    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  48.49 
 
 		 1402 aa  1116    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  45.74 
 
 		 1438 aa  1039    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  47.7 
 
 		 1433 aa  1084    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  42.78 
 
 		 1465 aa  919    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  47.7 
 
 		 1433 aa  1084    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  47.2 
 
 		 1433 aa  1078    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  43.76 
 
 		 1443 aa  1009    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  49.13 
 
 		 1444 aa  1153    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  42.96 
 
 		 1479 aa  938    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  52.16 
 
 		 1214 aa  886    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  100 
 
 		 1362 aa  2764    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  47.62 
 
 		 1433 aa  1080    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  46.81 
 
 		 1421 aa  1036    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  47.49 
 
 		 1426 aa  1095    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  40.79 
 
 		 1438 aa  801    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  48.46 
 
 		 1210 aa  823    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  44.28 
 
 		 1527 aa  1017    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  44.49 
 
 		 1449 aa  1065    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  44.41 
 
 		 1449 aa  1062    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  39.84 
 
 		 1442 aa  771    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  55.29 
 
 		 1367 aa  1434    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  42.62 
 
 		 989 aa  640    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  47.27 
 
 		 1407 aa  1144    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  51.2 
 
 		 1212 aa  864    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  56.53 
 
 		 1390 aa  1522    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  44.61 
 
 		 1635 aa  976    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  42.72 
 
 		 1437 aa  925    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  43.33 
 
 		 1432 aa  967    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  42.69 
 
 		 1437 aa  934    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  43.57 
 
 		 1464 aa  988    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  55.44 
 
 		 1367 aa  1436    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  53.62 
 
 		 1388 aa  1256    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  47.7 
 
 		 1433 aa  1082    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  48.12 
 
 		 1442 aa  1110    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  47.29 
 
 		 1433 aa  1080    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  48.43 
 
 		 1397 aa  1114    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  45.74 
 
 		 1438 aa  1039    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  42.93 
 
 		 970 aa  559  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  54.45 
 
 		 483 aa  528  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  25.17 
 
 		 1176 aa  192  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  23.81 
 
 		 1132 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  23.25 
 
 		 1130 aa  174  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  24.47 
 
 		 1127 aa  174  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1148 aa  167  9e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  24.54 
 
 		 1181 aa  167  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  23.78 
 
 		 1139 aa  166  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  24.43 
 
 		 1454 aa  165  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  24.29 
 
 		 1476 aa  164  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  23.4 
 
 		 1510 aa  163  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0371  DNA polymerase III, alpha subunit  22.79 
 
 		 1485 aa  161  9e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  24.12 
 
 		 1165 aa  160  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  24.39 
 
 		 1134 aa  160  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3606  DNA polymerase III, alpha subunit  23.62 
 
 		 1178 aa  160  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402124  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  22.97 
 
 		 1156 aa  160  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  24.03 
 
 		 1151 aa  156  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2399  DNA polymerase III subunit alpha  24.46 
 
 		 1190 aa  156  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351088  normal  0.331114 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  22.98 
 
 		 1155 aa  156  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  26.37 
 
 		 1607 aa  155  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1784  DNA polymerase III subunit alpha  23.95 
 
 		 1177 aa  155  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  23.49 
 
 		 1157 aa  155  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  24.64 
 
 		 1228 aa  154  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  23.21 
 
 		 1167 aa  154  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4709  DNA polymerase III, alpha subunit  22.27 
 
 		 1214 aa  153  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204837  normal  0.0609725 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  23.1 
 
 		 1179 aa  153  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1296  DNA polymerase III, alpha subunit  23.16 
 
 		 1181 aa  152  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  22.73 
 
 		 1184 aa  152  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  24.31 
 
 		 1180 aa  152  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  23.52 
 
 		 1155 aa  152  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  25.11 
 
 		 1165 aa  152  5e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1798  DNA polymerase III subunit alpha  23.73 
 
 		 1177 aa  151  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  22.69 
 
 		 1172 aa  151  9e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  22.86 
 
 		 1156 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  23.9 
 
 		 1170 aa  151  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  44.13 
 
 		 584 aa  150  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  24.29 
 
 		 1122 aa  149  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2903  DNA polymerase III, alpha subunit  24.56 
 
 		 1177 aa  149  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1425  DNA polymerase III subunit alpha  24.56 
 
 		 1174 aa  149  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.59393 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  24.25 
 
 		 1165 aa  149  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  23.49 
 
 		 1170 aa  148  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  24.75 
 
 		 1162 aa  148  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  23.27 
 
 		 1225 aa  148  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  22.52 
 
 		 1159 aa  147  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  24.29 
 
 		 1240 aa  146  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  23.32 
 
 		 1145 aa  147  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  23.2 
 
 		 1145 aa  147  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0091  DNA polymerase III, alpha subunit  23.55 
 
 		 1279 aa  146  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483462  normal  0.136645 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  23.38 
 
 		 1170 aa  146  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  23.9 
 
 		 1148 aa  145  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>