99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0015 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0015  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0778805  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  48.35 
 
 
1073 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  40.91 
 
 
1308 aa  69.3  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.31 
 
 
1481 aa  52.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  37.31 
 
 
1553 aa  52.4  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.46 
 
 
1760 aa  52.4  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  34.12 
 
 
1102 aa  52  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  34.78 
 
 
1236 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  33.83 
 
 
449 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 
947 aa  48.9  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.46 
 
 
1686 aa  48.5  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  42.19 
 
 
386 aa  48.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 
901 aa  47.8  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  40.62 
 
 
489 aa  47.8  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  37.86 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 
389 aa  47  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0402  transcriptional regulator, CadC  29.23 
 
 
1124 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  40.62 
 
 
152 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  33.77 
 
 
567 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2215  serine/threonine protein kinase  32.81 
 
 
1152 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.62111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3123  hypothetical protein  32.81 
 
 
1392 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 
1078 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  34.33 
 
 
1510 aa  45.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.4 
 
 
1607 aa  45.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.39 
 
 
1623 aa  45.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.39 
 
 
1626 aa  44.7  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  37.1 
 
 
710 aa  44.3  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 
260 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  35.37 
 
 
343 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  37.29 
 
 
149 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  35.37 
 
 
343 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  37.29 
 
 
149 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  28.05 
 
 
1089 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  28.75 
 
 
1230 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  35.8 
 
 
440 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  28.05 
 
 
1089 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  29.03 
 
 
1157 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  41.07 
 
 
1033 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  27.42 
 
 
1152 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 
1046 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.39 
 
 
1609 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.99 
 
 
1547 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.99 
 
 
1398 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1517  transcriptional regulator, CadC  28.05 
 
 
1067 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.58 
 
 
1267 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.85 
 
 
1711 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  35.29 
 
 
320 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  27.4 
 
 
1334 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  35.48 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.89 
 
 
1617 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  28.05 
 
 
1075 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  27.07 
 
 
961 aa  43.5  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  26.76 
 
 
973 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  32.81 
 
 
418 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  43.28 
 
 
311 aa  42.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  41.38 
 
 
204 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.8 
 
 
1598 aa  42.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2272  pentapeptide repeat-containing protein  36.07 
 
 
681 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  34.55 
 
 
142 aa  42.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  30.09 
 
 
576 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  38.33 
 
 
234 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  39.34 
 
 
256 aa  42.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  31.53 
 
 
830 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  40.62 
 
 
493 aa  42  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  28.05 
 
 
1075 aa  42  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  31.58 
 
 
902 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  39.66 
 
 
182 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3552  pentapeptide repeat-containing protein  33.87 
 
 
415 aa  42  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3961  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
333 aa  42  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0697467 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  35.59 
 
 
360 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  26.83 
 
 
1092 aa  41.6  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  35.62 
 
 
151 aa  41.6  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  35.59 
 
 
360 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  35.59 
 
 
360 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  38.71 
 
 
147 aa  41.6  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  35.59 
 
 
360 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  35.59 
 
 
360 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  35.59 
 
 
360 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  32.99 
 
 
483 aa  41.6  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  34.92 
 
 
277 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.39 
 
 
1190 aa  41.2  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3926  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
430 aa  41.2  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.58 
 
 
1599 aa  41.6  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2142  pentapeptide repeat-containing protein  36.76 
 
 
202 aa  41.2  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30 
 
 
1583 aa  41.2  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  28.17 
 
 
969 aa  41.2  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  28.17 
 
 
969 aa  41.2  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  26.83 
 
 
1075 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  28.4 
 
 
361 aa  41.2  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  32.81 
 
 
600 aa  41.2  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  35.94 
 
 
333 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  40.62 
 
 
294 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  38.6 
 
 
734 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  26.83 
 
 
1063 aa  40.8  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  31.4 
 
 
264 aa  40.8  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 
214 aa  40.8  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  26.83 
 
 
1080 aa  40.8  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3923  pentapeptide repeat protein  41.54 
 
 
167 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0131528  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  38.1 
 
 
267 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>