More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0663 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 145 aa  285  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  76.07 
 
 		 175 aa  183  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  73.5 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  70.54 
 
 		 277 aa  163  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  63.57 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  68.38 
 
 		 325 aa  160  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  73.39 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0067  XRE family transcriptional regulator  69.52 
 
 		 233 aa  154  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  67.29 
 
 		 141 aa  144  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  57.34 
 
 		 165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  56.3 
 
 		 170 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  67.29 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  63.72 
 
 		 140 aa  143  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  65.14 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  65.14 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  65.14 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  65.09 
 
 		 176 aa  140  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  63.46 
 
 		 182 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  60.91 
 
 		 191 aa  135  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  60.36 
 
 		 191 aa  134  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  60 
 
 		 128 aa  134  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  62.04 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  59.62 
 
 		 183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  46.49 
 
 		 156 aa  94  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  28.16 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_277  DNA-binding protein  38.14 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000765574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  36.49 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  36.49 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  36.49 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  35.62 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  36.49 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  37.11 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  35.14 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0315  helix-turn-helix domain-containing protein  42.42 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138688  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 196 aa  52.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 199 aa  52.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 199 aa  52.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 197 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  45.45 
 
 		 255 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  33.78 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 		 190 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 190 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 181 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 204 aa  51.2  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 193 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3681  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 199 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  44.83 
 
 		 179 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 190 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  44.83 
 
 		 179 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 190 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  44.83 
 
 		 179 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  44.83 
 
 		 179 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  44.83 
 
 		 191 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  44.83 
 
 		 179 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  44.83 
 
 		 179 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 236 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 189 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 236 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 193 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 223 aa  50.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 192 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 192 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 192 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 192 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 192 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 197 aa  50.1  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 198 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1142  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000709447  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 250 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  27.45 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5157  XRE family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086798  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 245 aa  48.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1953  transcriptional regulator, XRE family  31.19 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 201 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 196 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  34.15 
 
 		 464 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  37.14 
 
 		 421 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  43.94 
 
 		 202 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  37.14 
 
 		 421 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0893  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00171565  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  45.61 
 
 		 195 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 72 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1750  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00805015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>