More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1265 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  100 
 
 
235 aa  476  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  40.17 
 
 
235 aa  179  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  38.77 
 
 
224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  42.51 
 
 
248 aa  169  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  44.35 
 
 
235 aa  169  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  42.92 
 
 
280 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  44.3 
 
 
242 aa  165  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  43.35 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  44.49 
 
 
231 aa  161  8.000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  45.41 
 
 
236 aa  160  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  44.71 
 
 
222 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  40.09 
 
 
257 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  37.89 
 
 
230 aa  159  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  41.67 
 
 
244 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  41.78 
 
 
276 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1431  alanine racemase domain protein  46.29 
 
 
230 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  35.74 
 
 
235 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 
227 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  43.56 
 
 
262 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  42.67 
 
 
228 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  44.63 
 
 
242 aa  155  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  44.76 
 
 
237 aa  155  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1232  alanine racemase domain protein  44.6 
 
 
228 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  42.54 
 
 
228 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  41.41 
 
 
235 aa  155  6e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  42.92 
 
 
271 aa  155  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  41.94 
 
 
272 aa  154  8e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  42.31 
 
 
219 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  41.38 
 
 
244 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  42.79 
 
 
229 aa  153  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  41.12 
 
 
224 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  41.05 
 
 
228 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  40.74 
 
 
224 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  41.67 
 
 
230 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  45.87 
 
 
221 aa  153  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  40.99 
 
 
244 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  42.03 
 
 
241 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  41.99 
 
 
231 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  43.84 
 
 
234 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  43.72 
 
 
234 aa  153  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  44.89 
 
 
232 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  42.29 
 
 
228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  42.67 
 
 
271 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  37.18 
 
 
233 aa  152  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  40.35 
 
 
228 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  43.23 
 
 
231 aa  152  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  35.78 
 
 
235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  42.73 
 
 
228 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  38.26 
 
 
243 aa  151  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  40.59 
 
 
235 aa  151  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  41.85 
 
 
228 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  42.04 
 
 
231 aa  150  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  42.86 
 
 
237 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  40.27 
 
 
224 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  40.44 
 
 
240 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  44.39 
 
 
231 aa  149  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  37.66 
 
 
234 aa  149  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  42.15 
 
 
229 aa  149  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  37.99 
 
 
226 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  41.05 
 
 
236 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  41.92 
 
 
228 aa  148  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  34.55 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  41.78 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  40.87 
 
 
230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  37.61 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  40.26 
 
 
230 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  40.91 
 
 
226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  39.32 
 
 
218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  38.33 
 
 
225 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  39.22 
 
 
244 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  41.37 
 
 
248 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  40.52 
 
 
229 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  41.23 
 
 
222 aa  143  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  37.5 
 
 
220 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40339  predicted protein  42.79 
 
 
237 aa  143  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  37.66 
 
 
269 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  37.34 
 
 
261 aa  142  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  42.06 
 
 
271 aa  142  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  43.91 
 
 
232 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  42.55 
 
 
235 aa  142  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  42.04 
 
 
228 aa  141  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0491  alanine racemase domain protein  38.43 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000538385  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  42.73 
 
 
240 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  40.79 
 
 
229 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  37.34 
 
 
261 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3709  alanine racemase domain-containing protein  39.48 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.948517  normal  0.0157517 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  33.93 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  38.36 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4113  hypothetical protein  43.78 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  38.89 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  42.29 
 
 
229 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  40.95 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  35.22 
 
 
231 aa  139  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  38.18 
 
 
226 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  39.74 
 
 
237 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  41.63 
 
 
212 aa  138  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  40.09 
 
 
233 aa  138  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  33.48 
 
 
275 aa  138  7e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  40.43 
 
 
232 aa  138  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  40.97 
 
 
229 aa  138  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>