More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10042 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10042  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  502  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0859  regulatory protein GntR, HTH  60.93 
 
 		 217 aa  272  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.774142  decreased coverage  0.0091053 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5382  GntR family transcriptional regulator  60 
 
 		 220 aa  258  6e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5471  GntR family transcriptional regulator  60 
 
 		 220 aa  258  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal  0.33272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5758  GntR family transcriptional regulator  59.55 
 
 		 220 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.470153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6046  regulatory protein GntR, HTH  60.27 
 
 		 221 aa  247  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2517  transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3933  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 282 aa  95.5  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.903638  decreased coverage  0.00636181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2514  transcriptional regulator, GntR family  32.45 
 
 		 273 aa  95.5  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00436634  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1565  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 215 aa  95.1  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  29.61 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  30.6 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4602  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 219 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 219 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1495  regulatory protein GntR HTH  34.58 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  28.76 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  32.73 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  31.54 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  26.36 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2904  transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  28.66 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  25.25 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  32.58 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  23.56 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  22.07 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  36.19 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  36.96 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  25.32 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  35 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  33.33 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1295  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2185  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  34.95 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3025  GntR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  27.94 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  29.09 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>