134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1076 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  100 
 
 		 1937 aa  3878    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  97.61 
 
 		 1467 aa  1172    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2080  GLUG domain protein  29.5 
 
 		 3333 aa  301  1e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  30.93 
 
 		 1977 aa  255  5.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  41.69 
 
 		 1821 aa  254  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.56 
 
 		 4855 aa  175  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1073  hypothetical protein  93.42 
 
 		 84 aa  149  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.680757  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  38.75 
 
 		 1013 aa  147  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  33.1 
 
 		 2716 aa  142  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  55.19 
 
 		 2744 aa  131  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  37 
 
 		 1672 aa  129  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  45.97 
 
 		 1419 aa  127  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  45.14 
 
 		 1009 aa  126  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0211  hypothetical protein  33.55 
 
 		 741 aa  120  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.552995  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2866  GLUG domain protein  33.61 
 
 		 2267 aa  117  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.43 
 
 		 759 aa  113  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  42.05 
 
 		 437 aa  111  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4098  hypothetical protein  33.81 
 
 		 1064 aa  107  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3373  GLUG domain protein  35.06 
 
 		 578 aa  104  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  35.68 
 
 		 691 aa  101  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  37.5 
 
 		 981 aa  100  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1547  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1181 aa  98.6  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0222453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  37.29 
 
 		 1300 aa  93.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.89 
 
 		 1004 aa  89  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0747  GLUG  48.87 
 
 		 454 aa  88.6  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.120548  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  40.24 
 
 		 1048 aa  87.8  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.76 
 
 		 1081 aa  87.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  38.69 
 
 		 570 aa  86.7  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  33.89 
 
 		 4630 aa  86.3  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.32 
 
 		 1637 aa  81.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  32.65 
 
 		 1003 aa  79.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  37.71 
 
 		 715 aa  78.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.05 
 
 		 1148 aa  77.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  56.79 
 
 		 526 aa  77  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.79 
 
 		 2387 aa  76.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3394  metallophosphoesterase  27.86 
 
 		 1855 aa  76.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  36.44 
 
 		 2328 aa  75.9  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  36.78 
 
 		 1018 aa  75.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.72 
 
 		 808 aa  75.9  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0623  protein of unknown function DUF291  50 
 
 		 2205 aa  74.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.578825  unclonable  0.00000000542423 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  33.13 
 
 		 1831 aa  72.4  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  48.75 
 
 		 556 aa  72.4  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  33.07 
 
 		 1009 aa  72  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.55 
 
 		 985 aa  71.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  35.29 
 
 		 220 aa  70.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  38.62 
 
 		 1226 aa  70.5  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  48.78 
 
 		 758 aa  69.7  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  37.25 
 
 		 1417 aa  69.7  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  48 
 
 		 788 aa  69.3  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  46.91 
 
 		 1756 aa  69.3  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  42.42 
 
 		 1058 aa  69.3  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.03 
 
 		 1137 aa  68.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  32.45 
 
 		 2638 aa  67.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2596  Ig domain-containing protein  32.39 
 
 		 390 aa  68.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000321445  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  33.84 
 
 		 991 aa  67.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48 
 
 		 788 aa  67  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.61 
 
 		 790 aa  66.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  48 
 
 		 788 aa  67  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  35.92 
 
 		 2073 aa  66.6  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.67 
 
 		 788 aa  66.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  45.33 
 
 		 788 aa  66.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  46.67 
 
 		 788 aa  66.2  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  30.67 
 
 		 1421 aa  66.2  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1889  Ig domain-containing protein  34.05 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  47.37 
 
 		 652 aa  65.5  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  45.33 
 
 		 788 aa  65.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.67 
 
 		 788 aa  65.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  30.99 
 
 		 1279 aa  65.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  37.38 
 
 		 1729 aa  65.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  0.0000607429 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  40.54 
 
 		 428 aa  65.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  47.37 
 
 		 551 aa  64.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  45.33 
 
 		 788 aa  63.9  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  41.11 
 
 		 1030 aa  63.5  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0456  hypothetical protein  34.11 
 
 		 2764 aa  63.5  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.000000000000873422 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  42.47 
 
 		 1081 aa  63.2  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1053  hypothetical protein  37.21 
 
 		 514 aa  62.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.14 
 
 		 985 aa  62  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  32.36 
 
 		 2334 aa  61.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1665  Ig-like protein, group 2  35.66 
 
 		 462 aa  61.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0449982 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  36.67 
 
 		 576 aa  60.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0165  WD-40 repeat-containing protein  44 
 
 		 848 aa  60.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.748884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.9 
 
 		 639 aa  61.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0371  Ig domain-containing protein  30.63 
 
 		 472 aa  60.1  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.07 
 
 		 940 aa  59.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.12 
 
 		 4500 aa  59.3  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2341  agarase  39.8 
 
 		 1171 aa  57.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384937  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  51.56 
 
 		 554 aa  58.2  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2125  Ig domain-containing protein  34.65 
 
 		 472 aa  58.2  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1049  hypothetical protein  35.63 
 
 		 599 aa  58.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2198  phage tail protein  47.06 
 
 		 306 aa  57  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.36 
 
 		 857 aa  56.6  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0839  Ig-like, group 2  26.77 
 
 		 983 aa  55.8  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  43.37 
 
 		 1418 aa  55.5  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  25.5 
 
 		 1361 aa  55.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  33.54 
 
 		 730 aa  55.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  38.96 
 
 		 384 aa  54.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  41.76 
 
 		 1965 aa  54.7  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1969  GLUG domain protein  28.57 
 
 		 1143 aa  54.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000014348  decreased coverage  0.000000694878 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  27.67 
 
 		 1077 aa  54.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  46.97 
 
 		 715 aa  54.3  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>